Protein–RNA interactions for Protein: P26022

PTX3, Pentraxin-related protein PTX3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX3P26022 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTX3P26022 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTX3P26022 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTX3P26022 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTX3P26022 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTX3P26022 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTX3P26022 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTX3P26022 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTX3P26022 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTX3P26022 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTX3P26022 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTX3P26022 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTX3P26022 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTX3P26022 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTX3P26022 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTX3P26022 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTX3P26022 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTX3P26022 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTX3P26022 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTX3P26022 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTX3P26022 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTX3P26022 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTX3P26022 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTX3P26022 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTX3P26022 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PTX3P26022 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTX3P26022 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTX3P26022 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTX3P26022 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PTX3P26022 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTX3P26022 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTX3P26022 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTX3P26022 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTX3P26022 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTX3P26022 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTX3P26022 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTX3P26022 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTX3P26022 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTX3P26022 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTX3P26022 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTX3P26022 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTX3P26022 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTX3P26022 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTX3P26022 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTX3P26022 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTX3P26022 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTX3P26022 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTX3P26022 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PTX3P26022 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTX3P26022 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTX3P26022 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTX3P26022 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTX3P26022 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTX3P26022 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTX3P26022 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTX3P26022 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTX3P26022 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTX3P26022 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTX3P26022 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTX3P26022 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTX3P26022 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTX3P26022 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTX3P26022 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTX3P26022 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTX3P26022 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PTX3P26022 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PTX3P26022 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PTX3P26022 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTX3P26022 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTX3P26022 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTX3P26022 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTX3P26022 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTX3P26022 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTX3P26022 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTX3P26022 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTX3P26022 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTX3P26022 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTX3P26022 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTX3P26022 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PTX3P26022 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTX3P26022 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTX3P26022 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTX3P26022 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTX3P26022 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTX3P26022 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTX3P26022 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTX3P26022 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTX3P26022 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PTX3P26022 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTX3P26022 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTX3P26022 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTX3P26022 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTX3P26022 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTX3P26022 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTX3P26022 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTX3P26022 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTX3P26022 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTX3P26022 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTX3P26022 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTX3P26022 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms