Protein–RNA interactions for Protein: P23975

SLC6A2, Sodium-dependent noradrenaline transporter, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A2P23975 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC6A2P23975 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC6A2P23975 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC6A2P23975 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC6A2P23975 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC6A2P23975 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC6A2P23975 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC6A2P23975 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC6A2P23975 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC6A2P23975 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC6A2P23975 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC6A2P23975 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC6A2P23975 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC6A2P23975 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC6A2P23975 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC6A2P23975 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC6A2P23975 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC6A2P23975 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC6A2P23975 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC6A2P23975 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC6A2P23975 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC6A2P23975 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC6A2P23975 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC6A2P23975 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC6A2P23975 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC6A2P23975 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC6A2P23975 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC6A2P23975 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC6A2P23975 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC6A2P23975 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC6A2P23975 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC6A2P23975 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC6A2P23975 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC6A2P23975 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC6A2P23975 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC6A2P23975 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC6A2P23975 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC6A2P23975 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC6A2P23975 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC6A2P23975 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC6A2P23975 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC6A2P23975 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC6A2P23975 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC6A2P23975 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC6A2P23975 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC6A2P23975 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC6A2P23975 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC6A2P23975 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC6A2P23975 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC6A2P23975 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC6A2P23975 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC6A2P23975 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC6A2P23975 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC6A2P23975 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC6A2P23975 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC6A2P23975 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC6A2P23975 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC6A2P23975 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC6A2P23975 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC6A2P23975 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC6A2P23975 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC6A2P23975 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC6A2P23975 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC6A2P23975 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC6A2P23975 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC6A2P23975 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC6A2P23975 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC6A2P23975 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC6A2P23975 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC6A2P23975 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC6A2P23975 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC6A2P23975 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC6A2P23975 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC6A2P23975 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC6A2P23975 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC6A2P23975 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC6A2P23975 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC6A2P23975 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC6A2P23975 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC6A2P23975 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC6A2P23975 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC6A2P23975 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC6A2P23975 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC6A2P23975 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC6A2P23975 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC6A2P23975 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC6A2P23975 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC6A2P23975 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC6A2P23975 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC6A2P23975 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC6A2P23975 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC6A2P23975 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC6A2P23975 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC6A2P23975 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC6A2P23975 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC6A2P23975 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC6A2P23975 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC6A2P23975 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC6A2P23975 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC6A2P23975 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms