Protein–RNA interactions for Protein: P23942

PRPH2, Peripherin-2, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPH2P23942 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRPH2P23942 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRPH2P23942 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRPH2P23942 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRPH2P23942 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRPH2P23942 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRPH2P23942 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRPH2P23942 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRPH2P23942 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRPH2P23942 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRPH2P23942 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRPH2P23942 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRPH2P23942 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRPH2P23942 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRPH2P23942 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRPH2P23942 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRPH2P23942 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRPH2P23942 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRPH2P23942 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRPH2P23942 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRPH2P23942 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRPH2P23942 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRPH2P23942 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PRPH2P23942 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRPH2P23942 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRPH2P23942 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRPH2P23942 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRPH2P23942 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRPH2P23942 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRPH2P23942 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRPH2P23942 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRPH2P23942 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRPH2P23942 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRPH2P23942 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRPH2P23942 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRPH2P23942 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRPH2P23942 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRPH2P23942 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRPH2P23942 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRPH2P23942 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRPH2P23942 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PRPH2P23942 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRPH2P23942 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRPH2P23942 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRPH2P23942 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRPH2P23942 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PRPH2P23942 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRPH2P23942 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRPH2P23942 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRPH2P23942 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRPH2P23942 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRPH2P23942 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRPH2P23942 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PRPH2P23942 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRPH2P23942 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRPH2P23942 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRPH2P23942 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRPH2P23942 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRPH2P23942 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRPH2P23942 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRPH2P23942 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRPH2P23942 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRPH2P23942 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRPH2P23942 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRPH2P23942 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRPH2P23942 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRPH2P23942 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PRPH2P23942 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRPH2P23942 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRPH2P23942 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRPH2P23942 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRPH2P23942 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRPH2P23942 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRPH2P23942 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRPH2P23942 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRPH2P23942 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRPH2P23942 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRPH2P23942 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRPH2P23942 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRPH2P23942 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRPH2P23942 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRPH2P23942 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRPH2P23942 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRPH2P23942 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRPH2P23942 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRPH2P23942 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRPH2P23942 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRPH2P23942 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRPH2P23942 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PRPH2P23942 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRPH2P23942 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PRPH2P23942 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PRPH2P23942 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRPH2P23942 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRPH2P23942 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRPH2P23942 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRPH2P23942 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PRPH2P23942 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRPH2P23942 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRPH2P23942 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms