Protein–RNA interactions for Protein: P23759

PAX7, Paired box protein Pax-7, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX7P23759 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PAX7P23759 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PAX7P23759 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PAX7P23759 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PAX7P23759 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PAX7P23759 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PAX7P23759 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PAX7P23759 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PAX7P23759 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PAX7P23759 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PAX7P23759 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PAX7P23759 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PAX7P23759 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PAX7P23759 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PAX7P23759 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PAX7P23759 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PAX7P23759 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PAX7P23759 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PAX7P23759 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PAX7P23759 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PAX7P23759 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PAX7P23759 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PAX7P23759 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PAX7P23759 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PAX7P23759 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PAX7P23759 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PAX7P23759 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PAX7P23759 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PAX7P23759 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PAX7P23759 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PAX7P23759 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PAX7P23759 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PAX7P23759 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PAX7P23759 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PAX7P23759 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PAX7P23759 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PAX7P23759 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PAX7P23759 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PAX7P23759 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PAX7P23759 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PAX7P23759 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PAX7P23759 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PAX7P23759 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PAX7P23759 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PAX7P23759 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PAX7P23759 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PAX7P23759 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PAX7P23759 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PAX7P23759 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PAX7P23759 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PAX7P23759 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PAX7P23759 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PAX7P23759 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PAX7P23759 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PAX7P23759 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PAX7P23759 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PAX7P23759 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PAX7P23759 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PAX7P23759 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PAX7P23759 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PAX7P23759 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PAX7P23759 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PAX7P23759 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PAX7P23759 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PAX7P23759 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PAX7P23759 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PAX7P23759 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PAX7P23759 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PAX7P23759 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PAX7P23759 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PAX7P23759 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PAX7P23759 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PAX7P23759 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PAX7P23759 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PAX7P23759 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PAX7P23759 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PAX7P23759 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PAX7P23759 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PAX7P23759 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PAX7P23759 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PAX7P23759 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PAX7P23759 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PAX7P23759 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PAX7P23759 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PAX7P23759 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PAX7P23759 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PAX7P23759 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PAX7P23759 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PAX7P23759 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PAX7P23759 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PAX7P23759 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PAX7P23759 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PAX7P23759 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PAX7P23759 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PAX7P23759 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PAX7P23759 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PAX7P23759 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PAX7P23759 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PAX7P23759 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PAX7P23759 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms