Protein–RNA interactions for Protein: P23634

ATP2B4, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B4P23634 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ATP2B4P23634 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ATP2B4P23634 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ATP2B4P23634 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ATP2B4P23634 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
ATP2B4P23634 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ATP2B4P23634 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
ATP2B4P23634 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ATP2B4P23634 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ATP2B4P23634 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ATP2B4P23634 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ATP2B4P23634 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ATP2B4P23634 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ATP2B4P23634 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ATP2B4P23634 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ATP2B4P23634 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ATP2B4P23634 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ATP2B4P23634 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ATP2B4P23634 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ATP2B4P23634 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ATP2B4P23634 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ATP2B4P23634 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
ATP2B4P23634 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ATP2B4P23634 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ATP2B4P23634 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ATP2B4P23634 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ATP2B4P23634 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ATP2B4P23634 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ATP2B4P23634 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ATP2B4P23634 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ATP2B4P23634 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ATP2B4P23634 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ATP2B4P23634 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ATP2B4P23634 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ATP2B4P23634 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
ATP2B4P23634 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
ATP2B4P23634 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ATP2B4P23634 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ATP2B4P23634 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ATP2B4P23634 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
ATP2B4P23634 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ATP2B4P23634 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ATP2B4P23634 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ATP2B4P23634 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ATP2B4P23634 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ATP2B4P23634 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ATP2B4P23634 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ATP2B4P23634 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ATP2B4P23634 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ATP2B4P23634 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
ATP2B4P23634 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ATP2B4P23634 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ATP2B4P23634 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ATP2B4P23634 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ATP2B4P23634 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
ATP2B4P23634 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ATP2B4P23634 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
ATP2B4P23634 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ATP2B4P23634 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ATP2B4P23634 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ATP2B4P23634 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ATP2B4P23634 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
ATP2B4P23634 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ATP2B4P23634 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ATP2B4P23634 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
ATP2B4P23634 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ATP2B4P23634 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ATP2B4P23634 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ATP2B4P23634 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ATP2B4P23634 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ATP2B4P23634 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ATP2B4P23634 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ATP2B4P23634 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ATP2B4P23634 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ATP2B4P23634 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ATP2B4P23634 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ATP2B4P23634 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ATP2B4P23634 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ATP2B4P23634 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ATP2B4P23634 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ATP2B4P23634 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ATP2B4P23634 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ATP2B4P23634 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ATP2B4P23634 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ATP2B4P23634 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ATP2B4P23634 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ATP2B4P23634 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ATP2B4P23634 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ATP2B4P23634 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ATP2B4P23634 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ATP2B4P23634 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ATP2B4P23634 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ATP2B4P23634 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
ATP2B4P23634 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
ATP2B4P23634 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
ATP2B4P23634 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
ATP2B4P23634 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
ATP2B4P23634 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
ATP2B4P23634 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
ATP2B4P23634 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms