Protein–RNA interactions for Protein: P23327

HRC, Sarcoplasmic reticulum histidine-rich calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCP23327 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC36.39■■■■□ 3.42
HRCP23327 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC36.38■■■■□ 3.41
HRCP23327 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.38■■■■□ 3.41
HRCP23327 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
HRCP23327 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC36.38■■■■□ 3.41
HRCP23327 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
HRCP23327 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
HRCP23327 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
HRCP23327 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
HRCP23327 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC36.37■■■■□ 3.41
HRCP23327 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
HRCP23327 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
HRCP23327 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
HRCP23327 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
HRCP23327 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
HRCP23327 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
HRCP23327 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.35■■■■□ 3.41
HRCP23327 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
HRCP23327 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
HRCP23327 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
HRCP23327 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
HRCP23327 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
HRCP23327 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC36.34■■■■□ 3.41
HRCP23327 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC36.34■■■■□ 3.41
HRCP23327 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
HRCP23327 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
HRCP23327 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.33■■■■□ 3.41
HRCP23327 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.33■■■■□ 3.41
HRCP23327 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
HRCP23327 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC36.33■■■■□ 3.41
HRCP23327 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
HRCP23327 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
HRCP23327 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
HRCP23327 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.4
HRCP23327 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
HRCP23327 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
HRCP23327 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.4
HRCP23327 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.4
HRCP23327 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC36.32■■■■□ 3.4
HRCP23327 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
HRCP23327 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC36.31■■■■□ 3.4
HRCP23327 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
HRCP23327 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
HRCP23327 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC36.31■■■■□ 3.4
HRCP23327 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC36.31■■■■□ 3.4
HRCP23327 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
HRCP23327 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC36.31■■■■□ 3.4
HRCP23327 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
HRCP23327 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC36.3■■■■□ 3.4
HRCP23327 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
HRCP23327 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
HRCP23327 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC36.3■■■■□ 3.4
HRCP23327 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
HRCP23327 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
HRCP23327 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
HRCP23327 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
HRCP23327 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
HRCP23327 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
HRCP23327 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
HRCP23327 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
HRCP23327 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
HRCP23327 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
HRCP23327 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC36.27■■■■□ 3.4
HRCP23327 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
HRCP23327 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
HRCP23327 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
HRCP23327 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
HRCP23327 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
HRCP23327 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
HRCP23327 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
HRCP23327 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
HRCP23327 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
HRCP23327 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC36.26■■■■□ 3.4
HRCP23327 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC36.26■■■■□ 3.39
HRCP23327 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
HRCP23327 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
HRCP23327 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
HRCP23327 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
HRCP23327 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
HRCP23327 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
HRCP23327 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC36.24■■■■□ 3.39
HRCP23327 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
HRCP23327 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC36.24■■■■□ 3.39
HRCP23327 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
HRCP23327 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
HRCP23327 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
HRCP23327 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
HRCP23327 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
HRCP23327 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
HRCP23327 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
HRCP23327 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
HRCP23327 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
HRCP23327 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
HRCP23327 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
HRCP23327 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
HRCP23327 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC36.2■■■■□ 3.39
HRCP23327 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
HRCP23327 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
HRCP23327 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC36.2■■■■□ 3.39
HRCP23327 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC36.2■■■■□ 3.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms