Protein–RNA interactions for Protein: P23258

TUBG1, Tubulin gamma-1 chain, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBG1P23258 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TUBG1P23258 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TUBG1P23258 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TUBG1P23258 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TUBG1P23258 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TUBG1P23258 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TUBG1P23258 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TUBG1P23258 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TUBG1P23258 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TUBG1P23258 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TUBG1P23258 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TUBG1P23258 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TUBG1P23258 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TUBG1P23258 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TUBG1P23258 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TUBG1P23258 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TUBG1P23258 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TUBG1P23258 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TUBG1P23258 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
TUBG1P23258 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TUBG1P23258 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TUBG1P23258 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TUBG1P23258 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TUBG1P23258 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TUBG1P23258 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TUBG1P23258 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TUBG1P23258 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TUBG1P23258 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TUBG1P23258 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
TUBG1P23258 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TUBG1P23258 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TUBG1P23258 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TUBG1P23258 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TUBG1P23258 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
TUBG1P23258 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TUBG1P23258 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TUBG1P23258 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TUBG1P23258 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TUBG1P23258 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TUBG1P23258 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TUBG1P23258 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TUBG1P23258 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TUBG1P23258 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TUBG1P23258 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TUBG1P23258 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TUBG1P23258 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
TUBG1P23258 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
TUBG1P23258 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TUBG1P23258 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TUBG1P23258 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TUBG1P23258 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TUBG1P23258 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TUBG1P23258 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TUBG1P23258 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TUBG1P23258 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TUBG1P23258 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TUBG1P23258 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TUBG1P23258 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TUBG1P23258 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TUBG1P23258 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TUBG1P23258 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TUBG1P23258 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TUBG1P23258 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TUBG1P23258 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TUBG1P23258 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TUBG1P23258 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TUBG1P23258 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TUBG1P23258 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TUBG1P23258 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TUBG1P23258 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TUBG1P23258 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TUBG1P23258 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TUBG1P23258 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TUBG1P23258 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TUBG1P23258 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
TUBG1P23258 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
TUBG1P23258 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
TUBG1P23258 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TUBG1P23258 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TUBG1P23258 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TUBG1P23258 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TUBG1P23258 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TUBG1P23258 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TUBG1P23258 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TUBG1P23258 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TUBG1P23258 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TUBG1P23258 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TUBG1P23258 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TUBG1P23258 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TUBG1P23258 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TUBG1P23258 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TUBG1P23258 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TUBG1P23258 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TUBG1P23258 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TUBG1P23258 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TUBG1P23258 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TUBG1P23258 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TUBG1P23258 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TUBG1P23258 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TUBG1P23258 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms