Protein–RNA interactions for Protein: P21912

SDHB, Succinate dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur subunit, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDHBP21912 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SDHBP21912 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SDHBP21912 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SDHBP21912 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SDHBP21912 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SDHBP21912 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SDHBP21912 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SDHBP21912 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SDHBP21912 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SDHBP21912 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SDHBP21912 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SDHBP21912 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SDHBP21912 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SDHBP21912 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SDHBP21912 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SDHBP21912 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SDHBP21912 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SDHBP21912 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SDHBP21912 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SDHBP21912 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SDHBP21912 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SDHBP21912 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SDHBP21912 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SDHBP21912 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SDHBP21912 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SDHBP21912 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SDHBP21912 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SDHBP21912 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SDHBP21912 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SDHBP21912 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SDHBP21912 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SDHBP21912 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SDHBP21912 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SDHBP21912 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SDHBP21912 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SDHBP21912 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SDHBP21912 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SDHBP21912 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SDHBP21912 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SDHBP21912 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SDHBP21912 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SDHBP21912 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SDHBP21912 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SDHBP21912 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SDHBP21912 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SDHBP21912 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SDHBP21912 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SDHBP21912 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SDHBP21912 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SDHBP21912 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SDHBP21912 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SDHBP21912 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SDHBP21912 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SDHBP21912 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SDHBP21912 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SDHBP21912 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SDHBP21912 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SDHBP21912 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SDHBP21912 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SDHBP21912 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SDHBP21912 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SDHBP21912 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SDHBP21912 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SDHBP21912 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SDHBP21912 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SDHBP21912 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SDHBP21912 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SDHBP21912 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SDHBP21912 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SDHBP21912 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SDHBP21912 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SDHBP21912 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SDHBP21912 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SDHBP21912 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SDHBP21912 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SDHBP21912 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SDHBP21912 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SDHBP21912 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SDHBP21912 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SDHBP21912 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
SDHBP21912 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SDHBP21912 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SDHBP21912 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SDHBP21912 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SDHBP21912 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SDHBP21912 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SDHBP21912 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SDHBP21912 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SDHBP21912 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SDHBP21912 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SDHBP21912 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SDHBP21912 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SDHBP21912 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SDHBP21912 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SDHBP21912 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SDHBP21912 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SDHBP21912 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SDHBP21912 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SDHBP21912 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SDHBP21912 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms