Protein–RNA interactions for Protein: P21291

CSRP1, Cysteine and glycine-rich protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP1P21291 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CSRP1P21291 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CSRP1P21291 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CSRP1P21291 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CSRP1P21291 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CSRP1P21291 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CSRP1P21291 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSRP1P21291 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSRP1P21291 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSRP1P21291 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSRP1P21291 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSRP1P21291 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSRP1P21291 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSRP1P21291 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSRP1P21291 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CSRP1P21291 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CSRP1P21291 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CSRP1P21291 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CSRP1P21291 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CSRP1P21291 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CSRP1P21291 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CSRP1P21291 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CSRP1P21291 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CSRP1P21291 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CSRP1P21291 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSRP1P21291 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CSRP1P21291 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSRP1P21291 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CSRP1P21291 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSRP1P21291 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CSRP1P21291 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSRP1P21291 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSRP1P21291 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CSRP1P21291 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CSRP1P21291 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CSRP1P21291 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CSRP1P21291 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CSRP1P21291 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CSRP1P21291 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CSRP1P21291 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CSRP1P21291 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CSRP1P21291 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CSRP1P21291 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CSRP1P21291 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CSRP1P21291 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CSRP1P21291 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CSRP1P21291 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CSRP1P21291 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CSRP1P21291 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CSRP1P21291 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CSRP1P21291 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CSRP1P21291 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CSRP1P21291 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CSRP1P21291 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CSRP1P21291 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CSRP1P21291 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CSRP1P21291 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CSRP1P21291 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CSRP1P21291 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CSRP1P21291 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CSRP1P21291 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CSRP1P21291 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CSRP1P21291 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CSRP1P21291 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CSRP1P21291 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CSRP1P21291 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CSRP1P21291 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CSRP1P21291 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CSRP1P21291 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CSRP1P21291 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CSRP1P21291 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CSRP1P21291 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CSRP1P21291 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CSRP1P21291 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CSRP1P21291 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CSRP1P21291 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CSRP1P21291 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CSRP1P21291 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CSRP1P21291 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CSRP1P21291 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CSRP1P21291 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CSRP1P21291 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CSRP1P21291 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CSRP1P21291 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CSRP1P21291 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CSRP1P21291 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CSRP1P21291 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CSRP1P21291 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CSRP1P21291 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CSRP1P21291 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CSRP1P21291 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CSRP1P21291 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CSRP1P21291 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CSRP1P21291 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CSRP1P21291 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CSRP1P21291 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CSRP1P21291 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CSRP1P21291 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CSRP1P21291 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CSRP1P21291 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms