Protein–RNA interactions for Protein: P20309

CHRM3, Muscarinic acetylcholine receptor M3, humanhuman

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRM3P20309 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHRM3P20309 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
CHRM3P20309 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHRM3P20309 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CHRM3P20309 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHRM3P20309 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHRM3P20309 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHRM3P20309 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHRM3P20309 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHRM3P20309 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHRM3P20309 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHRM3P20309 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHRM3P20309 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHRM3P20309 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHRM3P20309 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHRM3P20309 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHRM3P20309 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHRM3P20309 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHRM3P20309 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHRM3P20309 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHRM3P20309 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHRM3P20309 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHRM3P20309 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHRM3P20309 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHRM3P20309 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHRM3P20309 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHRM3P20309 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHRM3P20309 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHRM3P20309 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHRM3P20309 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHRM3P20309 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHRM3P20309 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHRM3P20309 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHRM3P20309 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CHRM3P20309 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHRM3P20309 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHRM3P20309 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHRM3P20309 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHRM3P20309 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHRM3P20309 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHRM3P20309 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHRM3P20309 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHRM3P20309 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHRM3P20309 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHRM3P20309 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHRM3P20309 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHRM3P20309 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHRM3P20309 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHRM3P20309 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHRM3P20309 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHRM3P20309 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHRM3P20309 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHRM3P20309 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHRM3P20309 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHRM3P20309 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHRM3P20309 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHRM3P20309 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHRM3P20309 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHRM3P20309 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHRM3P20309 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CHRM3P20309 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHRM3P20309 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHRM3P20309 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHRM3P20309 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHRM3P20309 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHRM3P20309 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHRM3P20309 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHRM3P20309 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHRM3P20309 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHRM3P20309 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CHRM3P20309 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHRM3P20309 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CHRM3P20309 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHRM3P20309 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CHRM3P20309 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHRM3P20309 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHRM3P20309 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHRM3P20309 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHRM3P20309 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHRM3P20309 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHRM3P20309 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CHRM3P20309 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHRM3P20309 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CHRM3P20309 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHRM3P20309 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHRM3P20309 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHRM3P20309 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHRM3P20309 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHRM3P20309 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHRM3P20309 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHRM3P20309 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHRM3P20309 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHRM3P20309 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHRM3P20309 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHRM3P20309 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHRM3P20309 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHRM3P20309 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHRM3P20309 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHRM3P20309 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHRM3P20309 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms