Protein–RNA interactions for Protein: P20248

CCNA2, Cyclin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA2P20248 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCNA2P20248 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCNA2P20248 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCNA2P20248 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCNA2P20248 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCNA2P20248 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCNA2P20248 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCNA2P20248 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCNA2P20248 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCNA2P20248 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCNA2P20248 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCNA2P20248 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCNA2P20248 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CCNA2P20248 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CCNA2P20248 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CCNA2P20248 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCNA2P20248 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCNA2P20248 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCNA2P20248 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCNA2P20248 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CCNA2P20248 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCNA2P20248 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCNA2P20248 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCNA2P20248 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCNA2P20248 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CCNA2P20248 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCNA2P20248 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCNA2P20248 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCNA2P20248 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCNA2P20248 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCNA2P20248 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCNA2P20248 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCNA2P20248 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCNA2P20248 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCNA2P20248 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCNA2P20248 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCNA2P20248 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCNA2P20248 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CCNA2P20248 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCNA2P20248 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCNA2P20248 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCNA2P20248 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCNA2P20248 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCNA2P20248 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCNA2P20248 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCNA2P20248 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCNA2P20248 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCNA2P20248 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCNA2P20248 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCNA2P20248 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCNA2P20248 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCNA2P20248 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCNA2P20248 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCNA2P20248 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCNA2P20248 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCNA2P20248 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCNA2P20248 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCNA2P20248 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCNA2P20248 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCNA2P20248 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCNA2P20248 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCNA2P20248 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCNA2P20248 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCNA2P20248 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCNA2P20248 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCNA2P20248 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCNA2P20248 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CCNA2P20248 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCNA2P20248 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CCNA2P20248 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCNA2P20248 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCNA2P20248 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCNA2P20248 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCNA2P20248 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCNA2P20248 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCNA2P20248 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCNA2P20248 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCNA2P20248 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCNA2P20248 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCNA2P20248 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCNA2P20248 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCNA2P20248 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCNA2P20248 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCNA2P20248 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CCNA2P20248 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCNA2P20248 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCNA2P20248 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCNA2P20248 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCNA2P20248 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCNA2P20248 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCNA2P20248 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCNA2P20248 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCNA2P20248 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCNA2P20248 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCNA2P20248 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCNA2P20248 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCNA2P20248 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCNA2P20248 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCNA2P20248 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCNA2P20248 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms