Protein–RNA interactions for Protein: P20020

ATP2B1, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B1P20020 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ATP2B1P20020 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ATP2B1P20020 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ATP2B1P20020 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ATP2B1P20020 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ATP2B1P20020 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
ATP2B1P20020 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ATP2B1P20020 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ATP2B1P20020 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ATP2B1P20020 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
ATP2B1P20020 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
ATP2B1P20020 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ATP2B1P20020 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ATP2B1P20020 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ATP2B1P20020 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
ATP2B1P20020 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ATP2B1P20020 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
ATP2B1P20020 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ATP2B1P20020 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ATP2B1P20020 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ATP2B1P20020 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
ATP2B1P20020 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ATP2B1P20020 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ATP2B1P20020 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ATP2B1P20020 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ATP2B1P20020 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ATP2B1P20020 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ATP2B1P20020 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ATP2B1P20020 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ATP2B1P20020 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ATP2B1P20020 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ATP2B1P20020 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ATP2B1P20020 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ATP2B1P20020 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ATP2B1P20020 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ATP2B1P20020 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ATP2B1P20020 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ATP2B1P20020 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ATP2B1P20020 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ATP2B1P20020 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ATP2B1P20020 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ATP2B1P20020 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ATP2B1P20020 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ATP2B1P20020 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ATP2B1P20020 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ATP2B1P20020 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ATP2B1P20020 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ATP2B1P20020 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ATP2B1P20020 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ATP2B1P20020 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ATP2B1P20020 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ATP2B1P20020 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ATP2B1P20020 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ATP2B1P20020 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
ATP2B1P20020 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ATP2B1P20020 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ATP2B1P20020 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ATP2B1P20020 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ATP2B1P20020 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ATP2B1P20020 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.88
ATP2B1P20020 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
ATP2B1P20020 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
ATP2B1P20020 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.83■■□□□ 1.88
ATP2B1P20020 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
ATP2B1P20020 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ATP2B1P20020 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ATP2B1P20020 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ATP2B1P20020 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ATP2B1P20020 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ATP2B1P20020 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ATP2B1P20020 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ATP2B1P20020 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ATP2B1P20020 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ATP2B1P20020 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ATP2B1P20020 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ATP2B1P20020 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ATP2B1P20020 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ATP2B1P20020 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ATP2B1P20020 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ATP2B1P20020 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ATP2B1P20020 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATP2B1P20020 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATP2B1P20020 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATP2B1P20020 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATP2B1P20020 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATP2B1P20020 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATP2B1P20020 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATP2B1P20020 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATP2B1P20020 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
ATP2B1P20020 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATP2B1P20020 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATP2B1P20020 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATP2B1P20020 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATP2B1P20020 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATP2B1P20020 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATP2B1P20020 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ATP2B1P20020 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ATP2B1P20020 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ATP2B1P20020 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ATP2B1P20020 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms