Protein–RNA interactions for Protein: P19838

NFKB1, Nuclear factor NF-kappa-B p105 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKB1P19838 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NFKB1P19838 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NFKB1P19838 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NFKB1P19838 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NFKB1P19838 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NFKB1P19838 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NFKB1P19838 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NFKB1P19838 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
NFKB1P19838 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NFKB1P19838 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NFKB1P19838 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NFKB1P19838 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NFKB1P19838 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NFKB1P19838 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NFKB1P19838 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NFKB1P19838 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NFKB1P19838 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NFKB1P19838 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NFKB1P19838 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NFKB1P19838 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NFKB1P19838 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NFKB1P19838 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NFKB1P19838 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NFKB1P19838 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
NFKB1P19838 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NFKB1P19838 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NFKB1P19838 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NFKB1P19838 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NFKB1P19838 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NFKB1P19838 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NFKB1P19838 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NFKB1P19838 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NFKB1P19838 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NFKB1P19838 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NFKB1P19838 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NFKB1P19838 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NFKB1P19838 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
NFKB1P19838 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NFKB1P19838 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NFKB1P19838 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NFKB1P19838 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NFKB1P19838 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NFKB1P19838 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NFKB1P19838 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NFKB1P19838 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NFKB1P19838 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NFKB1P19838 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NFKB1P19838 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NFKB1P19838 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NFKB1P19838 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NFKB1P19838 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NFKB1P19838 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
NFKB1P19838 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NFKB1P19838 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NFKB1P19838 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NFKB1P19838 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NFKB1P19838 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NFKB1P19838 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
NFKB1P19838 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NFKB1P19838 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NFKB1P19838 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
NFKB1P19838 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
NFKB1P19838 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
NFKB1P19838 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
NFKB1P19838 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
NFKB1P19838 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NFKB1P19838 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NFKB1P19838 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NFKB1P19838 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NFKB1P19838 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NFKB1P19838 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NFKB1P19838 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NFKB1P19838 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NFKB1P19838 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NFKB1P19838 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NFKB1P19838 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NFKB1P19838 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NFKB1P19838 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NFKB1P19838 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NFKB1P19838 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NFKB1P19838 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NFKB1P19838 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
NFKB1P19838 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NFKB1P19838 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NFKB1P19838 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
NFKB1P19838 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NFKB1P19838 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NFKB1P19838 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NFKB1P19838 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NFKB1P19838 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NFKB1P19838 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
NFKB1P19838 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NFKB1P19838 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NFKB1P19838 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NFKB1P19838 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NFKB1P19838 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NFKB1P19838 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NFKB1P19838 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NFKB1P19838 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
NFKB1P19838 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms