Protein–RNA interactions for Protein: P18847

ATF3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF3P18847 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC32.92■■■□□ 2.86
ATF3P18847 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
ATF3P18847 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
ATF3P18847 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
ATF3P18847 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
ATF3P18847 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
ATF3P18847 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
ATF3P18847 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
ATF3P18847 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
ATF3P18847 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
ATF3P18847 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
ATF3P18847 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
ATF3P18847 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
ATF3P18847 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
ATF3P18847 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
ATF3P18847 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
ATF3P18847 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
ATF3P18847 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
ATF3P18847 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
ATF3P18847 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
ATF3P18847 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
ATF3P18847 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
ATF3P18847 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC32.87■■■□□ 2.85
ATF3P18847 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
ATF3P18847 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
ATF3P18847 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC32.85■■■□□ 2.85
ATF3P18847 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC32.85■■■□□ 2.85
ATF3P18847 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
ATF3P18847 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
ATF3P18847 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
ATF3P18847 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
ATF3P18847 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
ATF3P18847 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
ATF3P18847 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
ATF3P18847 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
ATF3P18847 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
ATF3P18847 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
ATF3P18847 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
ATF3P18847 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
ATF3P18847 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.85
ATF3P18847 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
ATF3P18847 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
ATF3P18847 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
ATF3P18847 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
ATF3P18847 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
ATF3P18847 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
ATF3P18847 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
ATF3P18847 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
ATF3P18847 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
ATF3P18847 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
ATF3P18847 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC32.8■■■□□ 2.84
ATF3P18847 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
ATF3P18847 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
ATF3P18847 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84
ATF3P18847 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
ATF3P18847 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
ATF3P18847 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
ATF3P18847 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
ATF3P18847 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
ATF3P18847 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
ATF3P18847 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
ATF3P18847 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
ATF3P18847 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
ATF3P18847 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
ATF3P18847 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
ATF3P18847 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
ATF3P18847 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.83
ATF3P18847 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
ATF3P18847 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
ATF3P18847 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
ATF3P18847 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC32.75■■■□□ 2.83
ATF3P18847 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
ATF3P18847 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
ATF3P18847 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
ATF3P18847 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
ATF3P18847 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
ATF3P18847 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
ATF3P18847 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
ATF3P18847 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
ATF3P18847 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
ATF3P18847 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
ATF3P18847 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
ATF3P18847 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
ATF3P18847 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
ATF3P18847 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
ATF3P18847 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
ATF3P18847 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
ATF3P18847 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
ATF3P18847 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
ATF3P18847 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
ATF3P18847 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
ATF3P18847 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
ATF3P18847 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
ATF3P18847 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
ATF3P18847 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
ATF3P18847 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
ATF3P18847 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
ATF3P18847 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
ATF3P18847 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC32.7■■■□□ 2.83
ATF3P18847 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC32.7■■■□□ 2.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms