Protein–RNA interactions for Protein: P18846

ATF1, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-1, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF1P18846 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATF1P18846 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATF1P18846 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATF1P18846 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATF1P18846 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATF1P18846 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATF1P18846 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
ATF1P18846 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATF1P18846 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATF1P18846 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATF1P18846 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATF1P18846 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATF1P18846 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
ATF1P18846 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
ATF1P18846 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATF1P18846 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATF1P18846 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATF1P18846 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATF1P18846 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATF1P18846 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATF1P18846 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATF1P18846 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATF1P18846 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATF1P18846 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATF1P18846 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATF1P18846 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATF1P18846 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATF1P18846 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATF1P18846 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATF1P18846 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATF1P18846 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ATF1P18846 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATF1P18846 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATF1P18846 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATF1P18846 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATF1P18846 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATF1P18846 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATF1P18846 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATF1P18846 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATF1P18846 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ATF1P18846 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATF1P18846 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATF1P18846 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATF1P18846 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATF1P18846 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATF1P18846 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATF1P18846 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATF1P18846 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATF1P18846 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATF1P18846 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ATF1P18846 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATF1P18846 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATF1P18846 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATF1P18846 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATF1P18846 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATF1P18846 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATF1P18846 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATF1P18846 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATF1P18846 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATF1P18846 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATF1P18846 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATF1P18846 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATF1P18846 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ATF1P18846 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATF1P18846 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATF1P18846 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATF1P18846 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATF1P18846 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATF1P18846 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATF1P18846 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATF1P18846 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ATF1P18846 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATF1P18846 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATF1P18846 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATF1P18846 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATF1P18846 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATF1P18846 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATF1P18846 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATF1P18846 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATF1P18846 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATF1P18846 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATF1P18846 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATF1P18846 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATF1P18846 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATF1P18846 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATF1P18846 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATF1P18846 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ATF1P18846 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATF1P18846 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATF1P18846 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATF1P18846 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATF1P18846 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATF1P18846 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATF1P18846 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATF1P18846 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATF1P18846 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.87
ATF1P18846 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ATF1P18846 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATF1P18846 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATF1P18846 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms