Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PTPRAP18433 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PTPRAP18433 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PTPRAP18433 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PTPRAP18433 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PTPRAP18433 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PTPRAP18433 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PTPRAP18433 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PTPRAP18433 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PTPRAP18433 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PTPRAP18433 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PTPRAP18433 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PTPRAP18433 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PTPRAP18433 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PTPRAP18433 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
PTPRAP18433 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
PTPRAP18433 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC27.57■■■□□ 2
PTPRAP18433 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PTPRAP18433 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PTPRAP18433 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PTPRAP18433 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PTPRAP18433 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PTPRAP18433 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PTPRAP18433 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PTPRAP18433 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
PTPRAP18433 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PTPRAP18433 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PTPRAP18433 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PTPRAP18433 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC27.55■■■□□ 2
PTPRAP18433 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PTPRAP18433 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC27.55■■■□□ 2
PTPRAP18433 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PTPRAP18433 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PTPRAP18433 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
PTPRAP18433 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PTPRAP18433 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PTPRAP18433 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PTPRAP18433 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PTPRAP18433 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PTPRAP18433 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PTPRAP18433 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PTPRAP18433 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PTPRAP18433 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PTPRAP18433 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PTPRAP18433 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC27.52■■■□□ 2
PTPRAP18433 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
PTPRAP18433 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PTPRAP18433 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
PTPRAP18433 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PTPRAP18433 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PTPRAP18433 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PTPRAP18433 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PTPRAP18433 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PTPRAP18433 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PTPRAP18433 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PTPRAP18433 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PTPRAP18433 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PTPRAP18433 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PTPRAP18433 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PTPRAP18433 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PTPRAP18433 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PTPRAP18433 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PTPRAP18433 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PTPRAP18433 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PTPRAP18433 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PTPRAP18433 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PTPRAP18433 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
PTPRAP18433 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PTPRAP18433 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PTPRAP18433 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PTPRAP18433 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PTPRAP18433 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
PTPRAP18433 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTPRAP18433 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTPRAP18433 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTPRAP18433 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTPRAP18433 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTPRAP18433 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTPRAP18433 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PTPRAP18433 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
PTPRAP18433 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PTPRAP18433 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PTPRAP18433 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PTPRAP18433 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PTPRAP18433 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PTPRAP18433 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PTPRAP18433 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PTPRAP18433 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PTPRAP18433 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PTPRAP18433 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
PTPRAP18433 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PTPRAP18433 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PTPRAP18433 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
PTPRAP18433 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PTPRAP18433 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PTPRAP18433 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PTPRAP18433 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PTPRAP18433 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
PTPRAP18433 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PTPRAP18433 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms