Protein–RNA interactions for Protein: P17707

AMD1, S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMD1P17707 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
AMD1P17707 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
AMD1P17707 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
AMD1P17707 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
AMD1P17707 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
AMD1P17707 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
AMD1P17707 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
AMD1P17707 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
AMD1P17707 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
AMD1P17707 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
AMD1P17707 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
AMD1P17707 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AMD1P17707 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
AMD1P17707 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AMD1P17707 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AMD1P17707 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
AMD1P17707 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
AMD1P17707 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AMD1P17707 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AMD1P17707 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
AMD1P17707 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
AMD1P17707 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
AMD1P17707 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
AMD1P17707 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
AMD1P17707 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23■■□□□ 1.27
AMD1P17707 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
AMD1P17707 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
AMD1P17707 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AMD1P17707 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AMD1P17707 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AMD1P17707 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AMD1P17707 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
AMD1P17707 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
AMD1P17707 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
AMD1P17707 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AMD1P17707 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AMD1P17707 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
AMD1P17707 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
AMD1P17707 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
AMD1P17707 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AMD1P17707 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AMD1P17707 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
AMD1P17707 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AMD1P17707 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AMD1P17707 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
AMD1P17707 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AMD1P17707 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AMD1P17707 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AMD1P17707 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AMD1P17707 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AMD1P17707 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
AMD1P17707 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
AMD1P17707 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AMD1P17707 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AMD1P17707 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
AMD1P17707 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AMD1P17707 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
AMD1P17707 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
AMD1P17707 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
AMD1P17707 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
AMD1P17707 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
AMD1P17707 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
AMD1P17707 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
AMD1P17707 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
AMD1P17707 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
AMD1P17707 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
AMD1P17707 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
AMD1P17707 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AMD1P17707 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AMD1P17707 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
AMD1P17707 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
AMD1P17707 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
AMD1P17707 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AMD1P17707 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
AMD1P17707 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AMD1P17707 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AMD1P17707 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AMD1P17707 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AMD1P17707 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AMD1P17707 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AMD1P17707 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AMD1P17707 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AMD1P17707 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
AMD1P17707 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
AMD1P17707 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
AMD1P17707 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
AMD1P17707 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
AMD1P17707 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AMD1P17707 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
AMD1P17707 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AMD1P17707 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
AMD1P17707 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
AMD1P17707 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
AMD1P17707 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
AMD1P17707 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
AMD1P17707 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
AMD1P17707 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
AMD1P17707 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AMD1P17707 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
AMD1P17707 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms