Protein–RNA interactions for Protein: P17405

SMPD1, Sphingomyelin phosphodiesterase, humanhuman

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPD1P17405 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SMPD1P17405 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SMPD1P17405 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SMPD1P17405 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SMPD1P17405 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SMPD1P17405 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SMPD1P17405 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SMPD1P17405 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SMPD1P17405 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SMPD1P17405 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
SMPD1P17405 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SMPD1P17405 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SMPD1P17405 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SMPD1P17405 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SMPD1P17405 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SMPD1P17405 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SMPD1P17405 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SMPD1P17405 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SMPD1P17405 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
SMPD1P17405 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SMPD1P17405 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SMPD1P17405 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SMPD1P17405 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SMPD1P17405 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SMPD1P17405 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SMPD1P17405 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SMPD1P17405 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SMPD1P17405 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
SMPD1P17405 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SMPD1P17405 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
SMPD1P17405 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SMPD1P17405 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
SMPD1P17405 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SMPD1P17405 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SMPD1P17405 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SMPD1P17405 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SMPD1P17405 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
SMPD1P17405 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SMPD1P17405 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SMPD1P17405 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SMPD1P17405 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
SMPD1P17405 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SMPD1P17405 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SMPD1P17405 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SMPD1P17405 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SMPD1P17405 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SMPD1P17405 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SMPD1P17405 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SMPD1P17405 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SMPD1P17405 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SMPD1P17405 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SMPD1P17405 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SMPD1P17405 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SMPD1P17405 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SMPD1P17405 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SMPD1P17405 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SMPD1P17405 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SMPD1P17405 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
SMPD1P17405 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SMPD1P17405 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SMPD1P17405 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SMPD1P17405 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SMPD1P17405 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
SMPD1P17405 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SMPD1P17405 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SMPD1P17405 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SMPD1P17405 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SMPD1P17405 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SMPD1P17405 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SMPD1P17405 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SMPD1P17405 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
SMPD1P17405 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SMPD1P17405 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SMPD1P17405 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SMPD1P17405 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SMPD1P17405 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SMPD1P17405 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SMPD1P17405 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SMPD1P17405 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SMPD1P17405 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SMPD1P17405 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
SMPD1P17405 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SMPD1P17405 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SMPD1P17405 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SMPD1P17405 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SMPD1P17405 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SMPD1P17405 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SMPD1P17405 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SMPD1P17405 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SMPD1P17405 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
SMPD1P17405 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SMPD1P17405 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SMPD1P17405 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SMPD1P17405 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SMPD1P17405 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SMPD1P17405 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SMPD1P17405 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SMPD1P17405 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SMPD1P17405 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SMPD1P17405 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms