Protein–RNA interactions for Protein: P16619

CCL3L1, C-C motif chemokine 3-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3L1P16619 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CCL3L1P16619 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CCL3L1P16619 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CCL3L1P16619 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CCL3L1P16619 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
CCL3L1P16619 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCL3L1P16619 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCL3L1P16619 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCL3L1P16619 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCL3L1P16619 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCL3L1P16619 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCL3L1P16619 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCL3L1P16619 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCL3L1P16619 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCL3L1P16619 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCL3L1P16619 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCL3L1P16619 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCL3L1P16619 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCL3L1P16619 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCL3L1P16619 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCL3L1P16619 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCL3L1P16619 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCL3L1P16619 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCL3L1P16619 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCL3L1P16619 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCL3L1P16619 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCL3L1P16619 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCL3L1P16619 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCL3L1P16619 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCL3L1P16619 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCL3L1P16619 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCL3L1P16619 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCL3L1P16619 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
CCL3L1P16619 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCL3L1P16619 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCL3L1P16619 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
CCL3L1P16619 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCL3L1P16619 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCL3L1P16619 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCL3L1P16619 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCL3L1P16619 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCL3L1P16619 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCL3L1P16619 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCL3L1P16619 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCL3L1P16619 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCL3L1P16619 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCL3L1P16619 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
CCL3L1P16619 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCL3L1P16619 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCL3L1P16619 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCL3L1P16619 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCL3L1P16619 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCL3L1P16619 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCL3L1P16619 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCL3L1P16619 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCL3L1P16619 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCL3L1P16619 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCL3L1P16619 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCL3L1P16619 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCL3L1P16619 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCL3L1P16619 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCL3L1P16619 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCL3L1P16619 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CCL3L1P16619 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCL3L1P16619 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CCL3L1P16619 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCL3L1P16619 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCL3L1P16619 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCL3L1P16619 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCL3L1P16619 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCL3L1P16619 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCL3L1P16619 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCL3L1P16619 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCL3L1P16619 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCL3L1P16619 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCL3L1P16619 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CCL3L1P16619 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCL3L1P16619 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCL3L1P16619 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCL3L1P16619 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCL3L1P16619 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCL3L1P16619 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCL3L1P16619 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CCL3L1P16619 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCL3L1P16619 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCL3L1P16619 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCL3L1P16619 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCL3L1P16619 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCL3L1P16619 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCL3L1P16619 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CCL3L1P16619 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCL3L1P16619 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCL3L1P16619 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCL3L1P16619 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCL3L1P16619 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCL3L1P16619 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCL3L1P16619 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCL3L1P16619 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CCL3L1P16619 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CCL3L1P16619 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms