Protein–RNA interactions for Protein: P15529

CD46, Membrane cofactor protein, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD46P15529 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CD46P15529 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CD46P15529 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CD46P15529 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CD46P15529 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CD46P15529 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CD46P15529 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CD46P15529 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CD46P15529 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
CD46P15529 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CD46P15529 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CD46P15529 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CD46P15529 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CD46P15529 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CD46P15529 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CD46P15529 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CD46P15529 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CD46P15529 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CD46P15529 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CD46P15529 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CD46P15529 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CD46P15529 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CD46P15529 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CD46P15529 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CD46P15529 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CD46P15529 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CD46P15529 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CD46P15529 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CD46P15529 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CD46P15529 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CD46P15529 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CD46P15529 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CD46P15529 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CD46P15529 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CD46P15529 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CD46P15529 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CD46P15529 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CD46P15529 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CD46P15529 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD46P15529 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CD46P15529 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD46P15529 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD46P15529 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD46P15529 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD46P15529 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD46P15529 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD46P15529 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD46P15529 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD46P15529 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD46P15529 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD46P15529 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD46P15529 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD46P15529 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD46P15529 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD46P15529 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD46P15529 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD46P15529 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD46P15529 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD46P15529 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CD46P15529 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CD46P15529 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CD46P15529 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CD46P15529 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CD46P15529 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CD46P15529 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CD46P15529 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CD46P15529 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CD46P15529 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CD46P15529 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CD46P15529 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CD46P15529 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CD46P15529 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CD46P15529 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CD46P15529 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CD46P15529 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CD46P15529 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CD46P15529 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CD46P15529 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CD46P15529 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CD46P15529 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CD46P15529 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CD46P15529 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CD46P15529 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CD46P15529 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CD46P15529 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CD46P15529 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CD46P15529 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CD46P15529 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CD46P15529 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CD46P15529 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CD46P15529 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CD46P15529 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CD46P15529 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CD46P15529 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CD46P15529 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CD46P15529 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CD46P15529 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CD46P15529 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CD46P15529 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CD46P15529 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms