Protein–RNA interactions for Protein: P14653

HOXB1, Homeobox protein Hox-B1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB1P14653 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXB1P14653 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXB1P14653 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXB1P14653 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXB1P14653 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXB1P14653 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXB1P14653 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXB1P14653 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXB1P14653 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXB1P14653 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXB1P14653 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXB1P14653 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXB1P14653 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXB1P14653 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXB1P14653 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXB1P14653 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXB1P14653 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXB1P14653 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXB1P14653 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXB1P14653 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXB1P14653 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXB1P14653 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXB1P14653 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXB1P14653 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXB1P14653 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXB1P14653 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXB1P14653 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXB1P14653 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXB1P14653 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXB1P14653 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXB1P14653 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXB1P14653 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXB1P14653 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXB1P14653 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXB1P14653 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXB1P14653 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXB1P14653 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXB1P14653 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXB1P14653 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXB1P14653 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXB1P14653 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXB1P14653 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXB1P14653 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXB1P14653 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXB1P14653 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXB1P14653 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXB1P14653 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXB1P14653 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXB1P14653 ATP5C1-201ENST00000335698 1078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXB1P14653 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXB1P14653 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXB1P14653 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXB1P14653 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXB1P14653 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXB1P14653 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXB1P14653 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXB1P14653 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
HOXB1P14653 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
HOXB1P14653 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
HOXB1P14653 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXB1P14653 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXB1P14653 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXB1P14653 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXB1P14653 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXB1P14653 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXB1P14653 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXB1P14653 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXB1P14653 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXB1P14653 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXB1P14653 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXB1P14653 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXB1P14653 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXB1P14653 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXB1P14653 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXB1P14653 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXB1P14653 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXB1P14653 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXB1P14653 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXB1P14653 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXB1P14653 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXB1P14653 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXB1P14653 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXB1P14653 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXB1P14653 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXB1P14653 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXB1P14653 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXB1P14653 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXB1P14653 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXB1P14653 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXB1P14653 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXB1P14653 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXB1P14653 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXB1P14653 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXB1P14653 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXB1P14653 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXB1P14653 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXB1P14653 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXB1P14653 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXB1P14653 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXB1P14653 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.5 ms