Protein–RNA interactions for Protein: P13797

PLS3, Plastin-3, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLS3P13797 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PLS3P13797 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PLS3P13797 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PLS3P13797 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PLS3P13797 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PLS3P13797 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PLS3P13797 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PLS3P13797 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PLS3P13797 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
PLS3P13797 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PLS3P13797 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PLS3P13797 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PLS3P13797 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PLS3P13797 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
PLS3P13797 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PLS3P13797 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PLS3P13797 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PLS3P13797 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PLS3P13797 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PLS3P13797 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PLS3P13797 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PLS3P13797 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PLS3P13797 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
PLS3P13797 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PLS3P13797 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PLS3P13797 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PLS3P13797 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PLS3P13797 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PLS3P13797 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PLS3P13797 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
PLS3P13797 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PLS3P13797 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PLS3P13797 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
PLS3P13797 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PLS3P13797 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PLS3P13797 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PLS3P13797 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PLS3P13797 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PLS3P13797 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PLS3P13797 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PLS3P13797 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PLS3P13797 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
PLS3P13797 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PLS3P13797 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PLS3P13797 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PLS3P13797 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PLS3P13797 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PLS3P13797 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PLS3P13797 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
PLS3P13797 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PLS3P13797 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PLS3P13797 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PLS3P13797 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PLS3P13797 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
PLS3P13797 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PLS3P13797 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PLS3P13797 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PLS3P13797 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PLS3P13797 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
PLS3P13797 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PLS3P13797 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PLS3P13797 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PLS3P13797 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
PLS3P13797 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
PLS3P13797 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PLS3P13797 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PLS3P13797 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PLS3P13797 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PLS3P13797 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PLS3P13797 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PLS3P13797 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PLS3P13797 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PLS3P13797 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PLS3P13797 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PLS3P13797 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PLS3P13797 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PLS3P13797 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PLS3P13797 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PLS3P13797 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PLS3P13797 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PLS3P13797 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PLS3P13797 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PLS3P13797 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
PLS3P13797 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PLS3P13797 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PLS3P13797 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PLS3P13797 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PLS3P13797 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PLS3P13797 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PLS3P13797 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PLS3P13797 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
PLS3P13797 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PLS3P13797 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PLS3P13797 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PLS3P13797 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PLS3P13797 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PLS3P13797 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PLS3P13797 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PLS3P13797 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PLS3P13797 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.8 ms