Protein–RNA interactions for Protein: P13765

HLA-DOB, HLA class II histocompatibility antigen, DO beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DOBP13765 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HLA-DOBP13765 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HLA-DOBP13765 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HLA-DOBP13765 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HLA-DOBP13765 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HLA-DOBP13765 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HLA-DOBP13765 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HLA-DOBP13765 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HLA-DOBP13765 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HLA-DOBP13765 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
HLA-DOBP13765 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HLA-DOBP13765 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HLA-DOBP13765 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HLA-DOBP13765 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HLA-DOBP13765 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HLA-DOBP13765 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HLA-DOBP13765 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HLA-DOBP13765 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HLA-DOBP13765 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
HLA-DOBP13765 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HLA-DOBP13765 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
HLA-DOBP13765 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
HLA-DOBP13765 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HLA-DOBP13765 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
HLA-DOBP13765 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
HLA-DOBP13765 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HLA-DOBP13765 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HLA-DOBP13765 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HLA-DOBP13765 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HLA-DOBP13765 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HLA-DOBP13765 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HLA-DOBP13765 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HLA-DOBP13765 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
HLA-DOBP13765 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HLA-DOBP13765 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HLA-DOBP13765 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HLA-DOBP13765 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
HLA-DOBP13765 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HLA-DOBP13765 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HLA-DOBP13765 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HLA-DOBP13765 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
HLA-DOBP13765 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HLA-DOBP13765 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HLA-DOBP13765 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HLA-DOBP13765 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HLA-DOBP13765 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HLA-DOBP13765 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HLA-DOBP13765 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HLA-DOBP13765 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HLA-DOBP13765 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HLA-DOBP13765 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HLA-DOBP13765 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HLA-DOBP13765 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HLA-DOBP13765 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HLA-DOBP13765 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HLA-DOBP13765 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HLA-DOBP13765 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HLA-DOBP13765 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
HLA-DOBP13765 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HLA-DOBP13765 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HLA-DOBP13765 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HLA-DOBP13765 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HLA-DOBP13765 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HLA-DOBP13765 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HLA-DOBP13765 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HLA-DOBP13765 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HLA-DOBP13765 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HLA-DOBP13765 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HLA-DOBP13765 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
HLA-DOBP13765 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
HLA-DOBP13765 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HLA-DOBP13765 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HLA-DOBP13765 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HLA-DOBP13765 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HLA-DOBP13765 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
HLA-DOBP13765 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HLA-DOBP13765 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HLA-DOBP13765 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HLA-DOBP13765 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HLA-DOBP13765 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HLA-DOBP13765 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HLA-DOBP13765 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HLA-DOBP13765 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
HLA-DOBP13765 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HLA-DOBP13765 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HLA-DOBP13765 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HLA-DOBP13765 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HLA-DOBP13765 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HLA-DOBP13765 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HLA-DOBP13765 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HLA-DOBP13765 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HLA-DOBP13765 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
HLA-DOBP13765 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HLA-DOBP13765 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HLA-DOBP13765 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HLA-DOBP13765 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HLA-DOBP13765 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HLA-DOBP13765 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HLA-DOBP13765 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HLA-DOBP13765 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms