Protein–RNA interactions for Protein: P13647

KRT5, Keratin, type II cytoskeletal 5, humanhuman

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT5P13647 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KRT5P13647 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KRT5P13647 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KRT5P13647 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KRT5P13647 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KRT5P13647 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KRT5P13647 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KRT5P13647 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KRT5P13647 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KRT5P13647 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KRT5P13647 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KRT5P13647 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KRT5P13647 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KRT5P13647 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KRT5P13647 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KRT5P13647 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KRT5P13647 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KRT5P13647 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KRT5P13647 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KRT5P13647 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KRT5P13647 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KRT5P13647 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KRT5P13647 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
KRT5P13647 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KRT5P13647 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KRT5P13647 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KRT5P13647 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KRT5P13647 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KRT5P13647 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KRT5P13647 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
KRT5P13647 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
KRT5P13647 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
KRT5P13647 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
KRT5P13647 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
KRT5P13647 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
KRT5P13647 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
KRT5P13647 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
KRT5P13647 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
KRT5P13647 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
KRT5P13647 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
KRT5P13647 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KRT5P13647 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KRT5P13647 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KRT5P13647 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
KRT5P13647 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
KRT5P13647 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KRT5P13647 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KRT5P13647 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KRT5P13647 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KRT5P13647 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KRT5P13647 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KRT5P13647 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KRT5P13647 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KRT5P13647 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KRT5P13647 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KRT5P13647 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KRT5P13647 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KRT5P13647 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KRT5P13647 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KRT5P13647 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KRT5P13647 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KRT5P13647 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KRT5P13647 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KRT5P13647 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KRT5P13647 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KRT5P13647 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KRT5P13647 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KRT5P13647 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KRT5P13647 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KRT5P13647 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KRT5P13647 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
KRT5P13647 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KRT5P13647 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KRT5P13647 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KRT5P13647 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KRT5P13647 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KRT5P13647 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KRT5P13647 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
KRT5P13647 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KRT5P13647 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KRT5P13647 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KRT5P13647 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KRT5P13647 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KRT5P13647 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KRT5P13647 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KRT5P13647 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KRT5P13647 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KRT5P13647 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
KRT5P13647 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
KRT5P13647 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
KRT5P13647 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KRT5P13647 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KRT5P13647 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KRT5P13647 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KRT5P13647 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KRT5P13647 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KRT5P13647 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KRT5P13647 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KRT5P13647 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KRT5P13647 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms