Protein–RNA interactions for Protein: P13569

CFTR, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, humanhuman

Predictions only

Length 1,480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFTRP13569 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC41.12■■■■■ 4.17
CFTRP13569 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC41.12■■■■■ 4.17
CFTRP13569 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC41.12■■■■■ 4.17
CFTRP13569 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.12■■■■■ 4.17
CFTRP13569 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.11■■■■■ 4.17
CFTRP13569 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.11■■■■■ 4.17
CFTRP13569 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC41.11■■■■■ 4.17
CFTRP13569 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
CFTRP13569 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC41.09■■■■■ 4.17
CFTRP13569 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC41.09■■■■■ 4.17
CFTRP13569 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC41.09■■■■■ 4.17
CFTRP13569 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC41.08■■■■■ 4.17
CFTRP13569 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.08■■■■■ 4.17
CFTRP13569 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.08■■■■■ 4.17
CFTRP13569 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC41.08■■■■■ 4.17
CFTRP13569 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC41.08■■■■■ 4.17
CFTRP13569 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
CFTRP13569 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.08■■■■■ 4.17
CFTRP13569 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.17
CFTRP13569 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.17
CFTRP13569 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.16
CFTRP13569 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.16
CFTRP13569 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.16
CFTRP13569 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC41.07■■■■■ 4.16
CFTRP13569 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.16
CFTRP13569 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC41.06■■■■■ 4.16
CFTRP13569 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC41.06■■■■■ 4.16
CFTRP13569 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.06■■■■■ 4.16
CFTRP13569 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC41.05■■■■■ 4.16
CFTRP13569 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.05■■■■■ 4.16
CFTRP13569 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC41.05■■■■■ 4.16
CFTRP13569 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.05■■■■■ 4.16
CFTRP13569 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC41.04■■■■■ 4.16
CFTRP13569 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC41.04■■■■■ 4.16
CFTRP13569 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
CFTRP13569 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
CFTRP13569 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
CFTRP13569 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
CFTRP13569 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC41.03■■■■■ 4.16
CFTRP13569 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
CFTRP13569 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.02■■■■■ 4.16
CFTRP13569 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC41.02■■■■■ 4.16
CFTRP13569 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC41.01■■■■■ 4.16
CFTRP13569 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC41.01■■■■■ 4.16
CFTRP13569 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.16
CFTRP13569 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC41.01■■■■■ 4.16
CFTRP13569 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC41.01■■■■■ 4.16
CFTRP13569 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4.15
CFTRP13569 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC41■■■■■ 4.15
CFTRP13569 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4.15
CFTRP13569 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC41■■■■■ 4.15
CFTRP13569 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC41■■■■■ 4.15
CFTRP13569 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC40.99■■■■■ 4.15
CFTRP13569 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.99■■■■■ 4.15
CFTRP13569 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
CFTRP13569 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.97■■■■■ 4.15
CFTRP13569 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.97■■■■■ 4.15
CFTRP13569 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC40.97■■■■■ 4.15
CFTRP13569 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC40.97■■■■■ 4.15
CFTRP13569 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.97■■■■■ 4.15
CFTRP13569 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.96■■■■■ 4.15
CFTRP13569 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC40.96■■■■■ 4.15
CFTRP13569 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC40.96■■■■■ 4.15
CFTRP13569 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC40.96■■■■■ 4.15
CFTRP13569 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.96■■■■■ 4.15
CFTRP13569 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC40.96■■■■■ 4.15
CFTRP13569 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC40.96■■■■■ 4.15
CFTRP13569 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC40.96■■■■■ 4.15
CFTRP13569 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC40.96■■■■■ 4.15
CFTRP13569 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC40.95■■■■■ 4.15
CFTRP13569 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC40.95■■■■■ 4.15
CFTRP13569 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.94■■■■■ 4.14
CFTRP13569 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC40.94■■■■■ 4.14
CFTRP13569 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.14
CFTRP13569 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.93■■■■■ 4.14
CFTRP13569 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC40.93■■■■■ 4.14
CFTRP13569 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC40.93■■■■■ 4.14
CFTRP13569 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC40.93■■■■■ 4.14
CFTRP13569 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC40.93■■■■■ 4.14
CFTRP13569 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.92■■■■■ 4.14
CFTRP13569 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.92■■■■■ 4.14
CFTRP13569 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.92■■■■■ 4.14
CFTRP13569 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC40.91■■■■■ 4.14
CFTRP13569 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
CFTRP13569 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC40.9■■■■■ 4.14
CFTRP13569 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
CFTRP13569 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
CFTRP13569 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
CFTRP13569 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
CFTRP13569 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
CFTRP13569 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC40.88■■■■■ 4.14
CFTRP13569 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC40.88■■■■■ 4.13
CFTRP13569 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.87■■■■■ 4.13
CFTRP13569 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC40.87■■■■■ 4.13
CFTRP13569 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.87■■■■■ 4.13
CFTRP13569 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC40.87■■■■■ 4.13
CFTRP13569 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.87■■■■■ 4.13
CFTRP13569 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.86■■■■■ 4.13
CFTRP13569 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC40.86■■■■■ 4.13
CFTRP13569 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.86■■■■■ 4.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms