Protein–RNA interactions for Protein: P12755

SKI, Ski oncogene, humanhuman

Predictions only

Length 728 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIP12755 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SKIP12755 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SKIP12755 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SKIP12755 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SKIP12755 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SKIP12755 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SKIP12755 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SKIP12755 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SKIP12755 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SKIP12755 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SKIP12755 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
SKIP12755 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SKIP12755 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SKIP12755 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SKIP12755 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SKIP12755 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SKIP12755 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SKIP12755 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SKIP12755 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
SKIP12755 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SKIP12755 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SKIP12755 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SKIP12755 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
SKIP12755 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SKIP12755 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
SKIP12755 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SKIP12755 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
SKIP12755 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SKIP12755 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SKIP12755 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SKIP12755 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SKIP12755 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SKIP12755 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SKIP12755 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SKIP12755 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SKIP12755 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SKIP12755 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SKIP12755 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
SKIP12755 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
SKIP12755 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SKIP12755 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SKIP12755 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SKIP12755 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SKIP12755 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
SKIP12755 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
SKIP12755 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
SKIP12755 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
SKIP12755 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SKIP12755 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SKIP12755 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SKIP12755 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SKIP12755 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SKIP12755 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SKIP12755 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SKIP12755 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SKIP12755 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SKIP12755 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SKIP12755 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SKIP12755 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SKIP12755 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SKIP12755 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SKIP12755 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SKIP12755 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SKIP12755 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SKIP12755 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SKIP12755 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SKIP12755 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SKIP12755 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SKIP12755 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SKIP12755 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SKIP12755 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SKIP12755 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SKIP12755 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SKIP12755 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SKIP12755 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SKIP12755 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SKIP12755 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SKIP12755 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SKIP12755 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SKIP12755 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SKIP12755 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SKIP12755 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SKIP12755 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SKIP12755 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SKIP12755 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SKIP12755 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SKIP12755 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SKIP12755 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SKIP12755 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SKIP12755 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SKIP12755 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SKIP12755 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SKIP12755 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SKIP12755 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SKIP12755 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SKIP12755 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SKIP12755 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SKIP12755 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SKIP12755 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SKIP12755 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms