Protein–RNA interactions for Protein: P12277

CKB, Creatine kinase B-type, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKBP12277 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CKBP12277 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CKBP12277 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CKBP12277 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CKBP12277 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CKBP12277 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CKBP12277 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CKBP12277 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CKBP12277 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CKBP12277 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CKBP12277 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CKBP12277 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CKBP12277 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CKBP12277 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CKBP12277 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CKBP12277 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CKBP12277 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CKBP12277 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CKBP12277 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CKBP12277 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CKBP12277 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CKBP12277 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CKBP12277 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CKBP12277 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CKBP12277 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CKBP12277 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CKBP12277 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CKBP12277 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CKBP12277 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CKBP12277 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CKBP12277 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CKBP12277 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CKBP12277 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CKBP12277 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CKBP12277 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CKBP12277 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CKBP12277 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CKBP12277 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CKBP12277 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CKBP12277 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CKBP12277 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CKBP12277 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CKBP12277 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CKBP12277 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CKBP12277 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CKBP12277 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CKBP12277 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CKBP12277 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CKBP12277 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CKBP12277 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CKBP12277 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CKBP12277 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CKBP12277 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CKBP12277 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CKBP12277 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CKBP12277 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CKBP12277 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CKBP12277 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CKBP12277 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CKBP12277 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CKBP12277 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CKBP12277 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CKBP12277 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CKBP12277 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CKBP12277 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CKBP12277 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CKBP12277 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CKBP12277 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CKBP12277 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CKBP12277 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CKBP12277 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CKBP12277 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CKBP12277 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CKBP12277 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CKBP12277 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CKBP12277 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CKBP12277 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CKBP12277 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CKBP12277 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CKBP12277 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
CKBP12277 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CKBP12277 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CKBP12277 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CKBP12277 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CKBP12277 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CKBP12277 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CKBP12277 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CKBP12277 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CKBP12277 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CKBP12277 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CKBP12277 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CKBP12277 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CKBP12277 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CKBP12277 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CKBP12277 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CKBP12277 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CKBP12277 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CKBP12277 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CKBP12277 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CKBP12277 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.1 ms