Protein–RNA interactions for Protein: P11279

LAMP1, Lysosome-associated membrane glycoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMP1P11279 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LAMP1P11279 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LAMP1P11279 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LAMP1P11279 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
LAMP1P11279 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LAMP1P11279 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LAMP1P11279 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LAMP1P11279 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LAMP1P11279 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LAMP1P11279 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LAMP1P11279 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LAMP1P11279 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LAMP1P11279 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LAMP1P11279 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LAMP1P11279 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LAMP1P11279 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LAMP1P11279 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LAMP1P11279 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LAMP1P11279 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LAMP1P11279 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LAMP1P11279 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LAMP1P11279 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LAMP1P11279 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LAMP1P11279 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LAMP1P11279 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LAMP1P11279 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LAMP1P11279 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LAMP1P11279 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LAMP1P11279 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LAMP1P11279 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LAMP1P11279 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LAMP1P11279 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LAMP1P11279 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LAMP1P11279 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
LAMP1P11279 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
LAMP1P11279 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
LAMP1P11279 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LAMP1P11279 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LAMP1P11279 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LAMP1P11279 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LAMP1P11279 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LAMP1P11279 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LAMP1P11279 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LAMP1P11279 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LAMP1P11279 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LAMP1P11279 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LAMP1P11279 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LAMP1P11279 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LAMP1P11279 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LAMP1P11279 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LAMP1P11279 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LAMP1P11279 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LAMP1P11279 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LAMP1P11279 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LAMP1P11279 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LAMP1P11279 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LAMP1P11279 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LAMP1P11279 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
LAMP1P11279 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
LAMP1P11279 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LAMP1P11279 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LAMP1P11279 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LAMP1P11279 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
LAMP1P11279 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LAMP1P11279 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LAMP1P11279 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LAMP1P11279 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LAMP1P11279 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
LAMP1P11279 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LAMP1P11279 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LAMP1P11279 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LAMP1P11279 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LAMP1P11279 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LAMP1P11279 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LAMP1P11279 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LAMP1P11279 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LAMP1P11279 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LAMP1P11279 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LAMP1P11279 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LAMP1P11279 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LAMP1P11279 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LAMP1P11279 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LAMP1P11279 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
LAMP1P11279 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LAMP1P11279 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LAMP1P11279 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LAMP1P11279 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LAMP1P11279 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LAMP1P11279 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LAMP1P11279 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LAMP1P11279 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LAMP1P11279 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LAMP1P11279 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LAMP1P11279 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LAMP1P11279 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LAMP1P11279 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LAMP1P11279 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LAMP1P11279 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LAMP1P11279 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LAMP1P11279 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms