Protein–RNA interactions for Protein: P0DN79

CBSL, Cystathionine beta-synthase-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBSLP0DN79 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CBSLP0DN79 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CBSLP0DN79 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CBSLP0DN79 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CBSLP0DN79 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CBSLP0DN79 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CBSLP0DN79 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CBSLP0DN79 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CBSLP0DN79 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CBSLP0DN79 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CBSLP0DN79 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CBSLP0DN79 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CBSLP0DN79 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CBSLP0DN79 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CBSLP0DN79 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CBSLP0DN79 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CBSLP0DN79 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CBSLP0DN79 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CBSLP0DN79 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CBSLP0DN79 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CBSLP0DN79 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CBSLP0DN79 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CBSLP0DN79 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CBSLP0DN79 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CBSLP0DN79 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CBSLP0DN79 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CBSLP0DN79 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CBSLP0DN79 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CBSLP0DN79 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CBSLP0DN79 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CBSLP0DN79 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CBSLP0DN79 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CBSLP0DN79 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CBSLP0DN79 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CBSLP0DN79 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CBSLP0DN79 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CBSLP0DN79 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CBSLP0DN79 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CBSLP0DN79 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CBSLP0DN79 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CBSLP0DN79 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CBSLP0DN79 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CBSLP0DN79 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CBSLP0DN79 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CBSLP0DN79 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CBSLP0DN79 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CBSLP0DN79 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CBSLP0DN79 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CBSLP0DN79 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CBSLP0DN79 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CBSLP0DN79 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CBSLP0DN79 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CBSLP0DN79 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CBSLP0DN79 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CBSLP0DN79 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CBSLP0DN79 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CBSLP0DN79 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CBSLP0DN79 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CBSLP0DN79 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CBSLP0DN79 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CBSLP0DN79 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CBSLP0DN79 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CBSLP0DN79 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CBSLP0DN79 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CBSLP0DN79 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CBSLP0DN79 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CBSLP0DN79 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CBSLP0DN79 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CBSLP0DN79 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CBSLP0DN79 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CBSLP0DN79 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CBSLP0DN79 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CBSLP0DN79 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CBSLP0DN79 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CBSLP0DN79 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CBSLP0DN79 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CBSLP0DN79 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CBSLP0DN79 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CBSLP0DN79 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CBSLP0DN79 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
CBSLP0DN79 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CBSLP0DN79 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CBSLP0DN79 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CBSLP0DN79 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CBSLP0DN79 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CBSLP0DN79 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CBSLP0DN79 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CBSLP0DN79 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CBSLP0DN79 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CBSLP0DN79 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CBSLP0DN79 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CBSLP0DN79 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CBSLP0DN79 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CBSLP0DN79 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CBSLP0DN79 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CBSLP0DN79 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CBSLP0DN79 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CBSLP0DN79 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CBSLP0DN79 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CBSLP0DN79 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms