Protein–RNA interactions for Protein: P0DJ93

SMIM13, Small integral membrane protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM13P0DJ93 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMIM13P0DJ93 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMIM13P0DJ93 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMIM13P0DJ93 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMIM13P0DJ93 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMIM13P0DJ93 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMIM13P0DJ93 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMIM13P0DJ93 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMIM13P0DJ93 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMIM13P0DJ93 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMIM13P0DJ93 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMIM13P0DJ93 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMIM13P0DJ93 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMIM13P0DJ93 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMIM13P0DJ93 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMIM13P0DJ93 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMIM13P0DJ93 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMIM13P0DJ93 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMIM13P0DJ93 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMIM13P0DJ93 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMIM13P0DJ93 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMIM13P0DJ93 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMIM13P0DJ93 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMIM13P0DJ93 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SMIM13P0DJ93 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SMIM13P0DJ93 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SMIM13P0DJ93 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SMIM13P0DJ93 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMIM13P0DJ93 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMIM13P0DJ93 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMIM13P0DJ93 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMIM13P0DJ93 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMIM13P0DJ93 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMIM13P0DJ93 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMIM13P0DJ93 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMIM13P0DJ93 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMIM13P0DJ93 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMIM13P0DJ93 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMIM13P0DJ93 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMIM13P0DJ93 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMIM13P0DJ93 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMIM13P0DJ93 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMIM13P0DJ93 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SMIM13P0DJ93 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMIM13P0DJ93 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMIM13P0DJ93 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMIM13P0DJ93 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMIM13P0DJ93 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMIM13P0DJ93 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMIM13P0DJ93 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMIM13P0DJ93 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMIM13P0DJ93 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMIM13P0DJ93 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMIM13P0DJ93 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMIM13P0DJ93 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMIM13P0DJ93 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMIM13P0DJ93 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMIM13P0DJ93 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SMIM13P0DJ93 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMIM13P0DJ93 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMIM13P0DJ93 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMIM13P0DJ93 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMIM13P0DJ93 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMIM13P0DJ93 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMIM13P0DJ93 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMIM13P0DJ93 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SMIM13P0DJ93 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMIM13P0DJ93 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMIM13P0DJ93 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMIM13P0DJ93 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMIM13P0DJ93 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMIM13P0DJ93 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMIM13P0DJ93 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMIM13P0DJ93 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMIM13P0DJ93 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMIM13P0DJ93 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SMIM13P0DJ93 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMIM13P0DJ93 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMIM13P0DJ93 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMIM13P0DJ93 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMIM13P0DJ93 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMIM13P0DJ93 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMIM13P0DJ93 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMIM13P0DJ93 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMIM13P0DJ93 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMIM13P0DJ93 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMIM13P0DJ93 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMIM13P0DJ93 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMIM13P0DJ93 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMIM13P0DJ93 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMIM13P0DJ93 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMIM13P0DJ93 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMIM13P0DJ93 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMIM13P0DJ93 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMIM13P0DJ93 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMIM13P0DJ93 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMIM13P0DJ93 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMIM13P0DJ93 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMIM13P0DJ93 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMIM13P0DJ93 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms