Protein–RNA interactions for Protein: P09497

CLTB, Clathrin light chain B, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTBP09497 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CLTBP09497 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CLTBP09497 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CLTBP09497 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CLTBP09497 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CLTBP09497 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CLTBP09497 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CLTBP09497 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CLTBP09497 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CLTBP09497 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CLTBP09497 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CLTBP09497 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CLTBP09497 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CLTBP09497 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CLTBP09497 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CLTBP09497 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CLTBP09497 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CLTBP09497 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CLTBP09497 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CLTBP09497 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CLTBP09497 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CLTBP09497 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CLTBP09497 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
CLTBP09497 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CLTBP09497 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CLTBP09497 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CLTBP09497 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
CLTBP09497 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CLTBP09497 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CLTBP09497 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CLTBP09497 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CLTBP09497 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CLTBP09497 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CLTBP09497 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CLTBP09497 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CLTBP09497 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CLTBP09497 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CLTBP09497 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CLTBP09497 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CLTBP09497 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CLTBP09497 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CLTBP09497 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CLTBP09497 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CLTBP09497 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CLTBP09497 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CLTBP09497 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CLTBP09497 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CLTBP09497 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CLTBP09497 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CLTBP09497 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CLTBP09497 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CLTBP09497 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CLTBP09497 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CLTBP09497 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CLTBP09497 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CLTBP09497 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CLTBP09497 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CLTBP09497 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CLTBP09497 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CLTBP09497 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CLTBP09497 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CLTBP09497 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CLTBP09497 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CLTBP09497 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CLTBP09497 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CLTBP09497 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CLTBP09497 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CLTBP09497 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CLTBP09497 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CLTBP09497 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CLTBP09497 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CLTBP09497 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CLTBP09497 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CLTBP09497 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CLTBP09497 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CLTBP09497 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CLTBP09497 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CLTBP09497 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CLTBP09497 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CLTBP09497 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CLTBP09497 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CLTBP09497 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CLTBP09497 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CLTBP09497 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CLTBP09497 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CLTBP09497 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CLTBP09497 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CLTBP09497 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CLTBP09497 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CLTBP09497 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CLTBP09497 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CLTBP09497 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CLTBP09497 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CLTBP09497 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CLTBP09497 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CLTBP09497 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CLTBP09497 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CLTBP09497 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CLTBP09497 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CLTBP09497 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
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