Protein–RNA interactions for Protein: P09238

MMP10, Stromelysin-2, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP10P09238 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
MMP10P09238 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
MMP10P09238 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
MMP10P09238 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
MMP10P09238 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
MMP10P09238 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
MMP10P09238 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
MMP10P09238 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
MMP10P09238 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
MMP10P09238 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
MMP10P09238 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
MMP10P09238 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
MMP10P09238 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
MMP10P09238 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
MMP10P09238 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
MMP10P09238 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
MMP10P09238 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
MMP10P09238 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
MMP10P09238 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
MMP10P09238 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
MMP10P09238 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
MMP10P09238 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
MMP10P09238 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
MMP10P09238 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
MMP10P09238 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
MMP10P09238 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
MMP10P09238 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
MMP10P09238 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
MMP10P09238 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
MMP10P09238 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
MMP10P09238 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
MMP10P09238 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
MMP10P09238 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
MMP10P09238 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
MMP10P09238 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
MMP10P09238 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
MMP10P09238 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
MMP10P09238 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
MMP10P09238 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
MMP10P09238 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
MMP10P09238 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
MMP10P09238 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
MMP10P09238 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
MMP10P09238 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
MMP10P09238 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
MMP10P09238 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
MMP10P09238 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
MMP10P09238 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
MMP10P09238 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
MMP10P09238 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
MMP10P09238 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
MMP10P09238 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
MMP10P09238 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
MMP10P09238 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
MMP10P09238 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
MMP10P09238 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
MMP10P09238 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
MMP10P09238 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
MMP10P09238 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
MMP10P09238 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
MMP10P09238 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
MMP10P09238 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
MMP10P09238 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
MMP10P09238 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
MMP10P09238 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
MMP10P09238 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
MMP10P09238 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
MMP10P09238 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
MMP10P09238 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
MMP10P09238 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
MMP10P09238 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
MMP10P09238 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
MMP10P09238 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
MMP10P09238 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
MMP10P09238 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
MMP10P09238 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
MMP10P09238 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
MMP10P09238 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
MMP10P09238 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
MMP10P09238 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
MMP10P09238 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
MMP10P09238 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
MMP10P09238 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
MMP10P09238 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
MMP10P09238 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
MMP10P09238 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
MMP10P09238 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
MMP10P09238 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
MMP10P09238 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
MMP10P09238 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
MMP10P09238 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
MMP10P09238 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
MMP10P09238 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
MMP10P09238 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
MMP10P09238 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
MMP10P09238 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
MMP10P09238 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
MMP10P09238 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
MMP10P09238 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
MMP10P09238 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms