Protein–RNA interactions for Protein: P09017

HOXC4, Homeobox protein Hox-C4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC4P09017 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXC4P09017 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXC4P09017 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXC4P09017 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXC4P09017 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXC4P09017 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXC4P09017 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HOXC4P09017 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HOXC4P09017 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
HOXC4P09017 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXC4P09017 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXC4P09017 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXC4P09017 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXC4P09017 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXC4P09017 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXC4P09017 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXC4P09017 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXC4P09017 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXC4P09017 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXC4P09017 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXC4P09017 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXC4P09017 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXC4P09017 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXC4P09017 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXC4P09017 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXC4P09017 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXC4P09017 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXC4P09017 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXC4P09017 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXC4P09017 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXC4P09017 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXC4P09017 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXC4P09017 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXC4P09017 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXC4P09017 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXC4P09017 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXC4P09017 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXC4P09017 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXC4P09017 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXC4P09017 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXC4P09017 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXC4P09017 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXC4P09017 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXC4P09017 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXC4P09017 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXC4P09017 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXC4P09017 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXC4P09017 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXC4P09017 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXC4P09017 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXC4P09017 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXC4P09017 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXC4P09017 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXC4P09017 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXC4P09017 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXC4P09017 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
HOXC4P09017 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
HOXC4P09017 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
HOXC4P09017 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXC4P09017 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXC4P09017 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXC4P09017 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXC4P09017 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXC4P09017 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXC4P09017 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXC4P09017 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXC4P09017 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXC4P09017 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXC4P09017 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXC4P09017 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXC4P09017 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXC4P09017 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXC4P09017 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXC4P09017 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXC4P09017 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXC4P09017 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXC4P09017 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXC4P09017 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXC4P09017 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXC4P09017 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXC4P09017 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXC4P09017 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXC4P09017 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXC4P09017 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXC4P09017 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXC4P09017 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXC4P09017 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXC4P09017 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXC4P09017 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXC4P09017 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXC4P09017 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXC4P09017 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXC4P09017 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXC4P09017 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXC4P09017 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXC4P09017 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXC4P09017 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXC4P09017 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXC4P09017 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXC4P09017 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms