Protein–RNA interactions for Protein: P08100

RHO, Rhodopsin, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOP08100 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RHOP08100 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RHOP08100 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RHOP08100 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RHOP08100 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RHOP08100 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RHOP08100 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RHOP08100 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RHOP08100 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RHOP08100 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
RHOP08100 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RHOP08100 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RHOP08100 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RHOP08100 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RHOP08100 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RHOP08100 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RHOP08100 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RHOP08100 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RHOP08100 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RHOP08100 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RHOP08100 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RHOP08100 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RHOP08100 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
RHOP08100 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RHOP08100 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RHOP08100 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RHOP08100 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RHOP08100 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RHOP08100 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RHOP08100 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RHOP08100 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
RHOP08100 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RHOP08100 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
RHOP08100 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
RHOP08100 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RHOP08100 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RHOP08100 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RHOP08100 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RHOP08100 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RHOP08100 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
RHOP08100 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RHOP08100 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RHOP08100 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RHOP08100 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
RHOP08100 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RHOP08100 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RHOP08100 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RHOP08100 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RHOP08100 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RHOP08100 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RHOP08100 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RHOP08100 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RHOP08100 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RHOP08100 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RHOP08100 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RHOP08100 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RHOP08100 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RHOP08100 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RHOP08100 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RHOP08100 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RHOP08100 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RHOP08100 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RHOP08100 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RHOP08100 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
RHOP08100 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RHOP08100 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RHOP08100 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
RHOP08100 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RHOP08100 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RHOP08100 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RHOP08100 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RHOP08100 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
RHOP08100 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RHOP08100 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RHOP08100 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RHOP08100 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RHOP08100 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RHOP08100 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RHOP08100 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RHOP08100 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RHOP08100 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RHOP08100 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RHOP08100 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RHOP08100 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RHOP08100 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RHOP08100 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RHOP08100 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RHOP08100 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RHOP08100 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RHOP08100 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RHOP08100 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RHOP08100 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RHOP08100 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RHOP08100 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RHOP08100 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RHOP08100 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
RHOP08100 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RHOP08100 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RHOP08100 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RHOP08100 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms