Protein–RNA interactions for Protein: P07437

TUBB, Tubulin beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBBP07437 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TUBBP07437 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TUBBP07437 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TUBBP07437 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TUBBP07437 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TUBBP07437 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TUBBP07437 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TUBBP07437 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TUBBP07437 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TUBBP07437 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TUBBP07437 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TUBBP07437 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TUBBP07437 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TUBBP07437 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TUBBP07437 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TUBBP07437 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TUBBP07437 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TUBBP07437 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TUBBP07437 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TUBBP07437 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TUBBP07437 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TUBBP07437 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TUBBP07437 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TUBBP07437 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TUBBP07437 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TUBBP07437 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TUBBP07437 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TUBBP07437 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TUBBP07437 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TUBBP07437 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TUBBP07437 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TUBBP07437 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TUBBP07437 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TUBBP07437 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TUBBP07437 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TUBBP07437 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TUBBP07437 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TUBBP07437 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TUBBP07437 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TUBBP07437 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TUBBP07437 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TUBBP07437 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TUBBP07437 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TUBBP07437 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TUBBP07437 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TUBBP07437 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TUBBP07437 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
TUBBP07437 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TUBBP07437 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TUBBP07437 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TUBBP07437 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TUBBP07437 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TUBBP07437 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TUBBP07437 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
TUBBP07437 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TUBBP07437 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TUBBP07437 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TUBBP07437 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TUBBP07437 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TUBBP07437 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TUBBP07437 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TUBBP07437 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TUBBP07437 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TUBBP07437 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TUBBP07437 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TUBBP07437 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TUBBP07437 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TUBBP07437 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TUBBP07437 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TUBBP07437 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TUBBP07437 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TUBBP07437 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TUBBP07437 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TUBBP07437 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TUBBP07437 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TUBBP07437 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TUBBP07437 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TUBBP07437 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TUBBP07437 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TUBBP07437 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TUBBP07437 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TUBBP07437 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TUBBP07437 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TUBBP07437 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TUBBP07437 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TUBBP07437 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TUBBP07437 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TUBBP07437 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TUBBP07437 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TUBBP07437 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TUBBP07437 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TUBBP07437 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TUBBP07437 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TUBBP07437 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TUBBP07437 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TUBBP07437 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TUBBP07437 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TUBBP07437 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TUBBP07437 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TUBBP07437 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms