Protein–RNA interactions for Protein: P06239

LCK, Tyrosine-protein kinase Lck, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCKP06239 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LCKP06239 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LCKP06239 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LCKP06239 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LCKP06239 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LCKP06239 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LCKP06239 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LCKP06239 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LCKP06239 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LCKP06239 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LCKP06239 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LCKP06239 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LCKP06239 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LCKP06239 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LCKP06239 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LCKP06239 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LCKP06239 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LCKP06239 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LCKP06239 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LCKP06239 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LCKP06239 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LCKP06239 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LCKP06239 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LCKP06239 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LCKP06239 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LCKP06239 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LCKP06239 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
LCKP06239 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LCKP06239 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LCKP06239 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LCKP06239 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LCKP06239 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LCKP06239 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
LCKP06239 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LCKP06239 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LCKP06239 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LCKP06239 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LCKP06239 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LCKP06239 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LCKP06239 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LCKP06239 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LCKP06239 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LCKP06239 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LCKP06239 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LCKP06239 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
LCKP06239 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LCKP06239 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LCKP06239 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LCKP06239 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LCKP06239 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LCKP06239 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LCKP06239 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LCKP06239 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LCKP06239 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
LCKP06239 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LCKP06239 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LCKP06239 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LCKP06239 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LCKP06239 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LCKP06239 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LCKP06239 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
LCKP06239 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LCKP06239 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LCKP06239 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LCKP06239 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LCKP06239 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LCKP06239 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LCKP06239 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LCKP06239 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LCKP06239 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LCKP06239 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LCKP06239 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LCKP06239 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LCKP06239 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LCKP06239 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LCKP06239 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LCKP06239 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
LCKP06239 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
LCKP06239 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LCKP06239 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LCKP06239 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LCKP06239 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LCKP06239 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LCKP06239 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LCKP06239 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LCKP06239 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LCKP06239 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LCKP06239 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LCKP06239 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LCKP06239 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LCKP06239 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LCKP06239 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LCKP06239 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LCKP06239 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LCKP06239 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LCKP06239 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LCKP06239 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LCKP06239 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LCKP06239 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LCKP06239 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.8 ms