Protein–RNA interactions for Protein: P05976

MYL1, Myosin light chain 1/3, skeletal muscle isoform, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYL1P05976 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
MYL1P05976 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
MYL1P05976 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
MYL1P05976 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
MYL1P05976 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MYL1P05976 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MYL1P05976 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MYL1P05976 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MYL1P05976 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MYL1P05976 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MYL1P05976 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MYL1P05976 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MYL1P05976 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MYL1P05976 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MYL1P05976 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MYL1P05976 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MYL1P05976 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MYL1P05976 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MYL1P05976 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
MYL1P05976 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MYL1P05976 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MYL1P05976 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
MYL1P05976 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MYL1P05976 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MYL1P05976 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MYL1P05976 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MYL1P05976 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MYL1P05976 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MYL1P05976 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MYL1P05976 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MYL1P05976 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MYL1P05976 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MYL1P05976 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MYL1P05976 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MYL1P05976 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
MYL1P05976 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MYL1P05976 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MYL1P05976 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
MYL1P05976 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MYL1P05976 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MYL1P05976 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MYL1P05976 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MYL1P05976 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MYL1P05976 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MYL1P05976 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MYL1P05976 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MYL1P05976 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MYL1P05976 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MYL1P05976 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
MYL1P05976 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MYL1P05976 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MYL1P05976 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MYL1P05976 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MYL1P05976 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MYL1P05976 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MYL1P05976 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MYL1P05976 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MYL1P05976 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MYL1P05976 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
MYL1P05976 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MYL1P05976 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MYL1P05976 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MYL1P05976 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MYL1P05976 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
MYL1P05976 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MYL1P05976 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MYL1P05976 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MYL1P05976 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MYL1P05976 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MYL1P05976 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MYL1P05976 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MYL1P05976 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
MYL1P05976 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
MYL1P05976 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MYL1P05976 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MYL1P05976 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
MYL1P05976 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MYL1P05976 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MYL1P05976 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MYL1P05976 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MYL1P05976 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MYL1P05976 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MYL1P05976 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
MYL1P05976 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MYL1P05976 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MYL1P05976 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MYL1P05976 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MYL1P05976 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MYL1P05976 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
MYL1P05976 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
MYL1P05976 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
MYL1P05976 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MYL1P05976 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
MYL1P05976 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MYL1P05976 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MYL1P05976 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC26■■□□□ 1.75
MYL1P05976 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
MYL1P05976 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MYL1P05976 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MYL1P05976 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms