Protein–RNA interactions for Protein: P04629

NTRK1, High affinity nerve growth factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK1P04629 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NTRK1P04629 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NTRK1P04629 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NTRK1P04629 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NTRK1P04629 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NTRK1P04629 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NTRK1P04629 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NTRK1P04629 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NTRK1P04629 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NTRK1P04629 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NTRK1P04629 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NTRK1P04629 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NTRK1P04629 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NTRK1P04629 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NTRK1P04629 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NTRK1P04629 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NTRK1P04629 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NTRK1P04629 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NTRK1P04629 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NTRK1P04629 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NTRK1P04629 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NTRK1P04629 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NTRK1P04629 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NTRK1P04629 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NTRK1P04629 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NTRK1P04629 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NTRK1P04629 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NTRK1P04629 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NTRK1P04629 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NTRK1P04629 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NTRK1P04629 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NTRK1P04629 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NTRK1P04629 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NTRK1P04629 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NTRK1P04629 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NTRK1P04629 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NTRK1P04629 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NTRK1P04629 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NTRK1P04629 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NTRK1P04629 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NTRK1P04629 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NTRK1P04629 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NTRK1P04629 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NTRK1P04629 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NTRK1P04629 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NTRK1P04629 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NTRK1P04629 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NTRK1P04629 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NTRK1P04629 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NTRK1P04629 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NTRK1P04629 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NTRK1P04629 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NTRK1P04629 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NTRK1P04629 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NTRK1P04629 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NTRK1P04629 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NTRK1P04629 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NTRK1P04629 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NTRK1P04629 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NTRK1P04629 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NTRK1P04629 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NTRK1P04629 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NTRK1P04629 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NTRK1P04629 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NTRK1P04629 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NTRK1P04629 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NTRK1P04629 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NTRK1P04629 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NTRK1P04629 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NTRK1P04629 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NTRK1P04629 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NTRK1P04629 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NTRK1P04629 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NTRK1P04629 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NTRK1P04629 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NTRK1P04629 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NTRK1P04629 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NTRK1P04629 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NTRK1P04629 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NTRK1P04629 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NTRK1P04629 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NTRK1P04629 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
NTRK1P04629 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NTRK1P04629 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NTRK1P04629 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NTRK1P04629 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NTRK1P04629 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NTRK1P04629 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NTRK1P04629 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NTRK1P04629 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NTRK1P04629 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NTRK1P04629 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NTRK1P04629 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NTRK1P04629 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NTRK1P04629 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NTRK1P04629 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NTRK1P04629 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NTRK1P04629 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NTRK1P04629 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NTRK1P04629 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms