Protein–RNA interactions for Protein: P04198

MYCN, N-myc proto-oncogene protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYCNP04198 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
MYCNP04198 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
MYCNP04198 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
MYCNP04198 AC107982.2-201ENST00000577360 463 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
MYCNP04198 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
MYCNP04198 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
MYCNP04198 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
MYCNP04198 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
MYCNP04198 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
MYCNP04198 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
MYCNP04198 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
MYCNP04198 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
MYCNP04198 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
MYCNP04198 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
MYCNP04198 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
MYCNP04198 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
MYCNP04198 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
MYCNP04198 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
MYCNP04198 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
MYCNP04198 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
MYCNP04198 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
MYCNP04198 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
MYCNP04198 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
MYCNP04198 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
MYCNP04198 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
MYCNP04198 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
MYCNP04198 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
MYCNP04198 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
MYCNP04198 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
MYCNP04198 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
MYCNP04198 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
MYCNP04198 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
MYCNP04198 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
MYCNP04198 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
MYCNP04198 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
MYCNP04198 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
MYCNP04198 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
MYCNP04198 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
MYCNP04198 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
MYCNP04198 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
MYCNP04198 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
MYCNP04198 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
MYCNP04198 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
MYCNP04198 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
MYCNP04198 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
MYCNP04198 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
MYCNP04198 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MYCNP04198 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MYCNP04198 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MYCNP04198 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
MYCNP04198 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MYCNP04198 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MYCNP04198 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
MYCNP04198 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MYCNP04198 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MYCNP04198 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MYCNP04198 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MYCNP04198 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MYCNP04198 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MYCNP04198 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MYCNP04198 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MYCNP04198 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MYCNP04198 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MYCNP04198 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
MYCNP04198 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
MYCNP04198 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
MYCNP04198 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MYCNP04198 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MYCNP04198 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MYCNP04198 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MYCNP04198 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MYCNP04198 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MYCNP04198 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MYCNP04198 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
MYCNP04198 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MYCNP04198 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MYCNP04198 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MYCNP04198 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
MYCNP04198 AC098799.1-201ENST00000504752 800 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
MYCNP04198 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
MYCNP04198 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
MYCNP04198 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MYCNP04198 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
MYCNP04198 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
MYCNP04198 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MYCNP04198 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
MYCNP04198 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
MYCNP04198 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
MYCNP04198 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
MYCNP04198 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
MYCNP04198 AC107419.1-202ENST00000608735 1081 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
MYCNP04198 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
MYCNP04198 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
MYCNP04198 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MYCNP04198 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
MYCNP04198 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
MYCNP04198 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MYCNP04198 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MYCNP04198 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MYCNP04198 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms