Protein–RNA interactions for Protein: P04150

NR3C1, Glucocorticoid receptor, humanhuman

Predictions only

Length 777 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR3C1P04150 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NR3C1P04150 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NR3C1P04150 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NR3C1P04150 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NR3C1P04150 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NR3C1P04150 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NR3C1P04150 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NR3C1P04150 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NR3C1P04150 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NR3C1P04150 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
NR3C1P04150 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
NR3C1P04150 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NR3C1P04150 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NR3C1P04150 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NR3C1P04150 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NR3C1P04150 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NR3C1P04150 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NR3C1P04150 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NR3C1P04150 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NR3C1P04150 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NR3C1P04150 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
NR3C1P04150 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
NR3C1P04150 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NR3C1P04150 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NR3C1P04150 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NR3C1P04150 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NR3C1P04150 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NR3C1P04150 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NR3C1P04150 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NR3C1P04150 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NR3C1P04150 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
NR3C1P04150 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NR3C1P04150 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NR3C1P04150 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NR3C1P04150 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NR3C1P04150 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NR3C1P04150 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NR3C1P04150 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NR3C1P04150 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NR3C1P04150 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NR3C1P04150 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NR3C1P04150 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NR3C1P04150 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NR3C1P04150 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NR3C1P04150 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NR3C1P04150 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NR3C1P04150 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
NR3C1P04150 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NR3C1P04150 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NR3C1P04150 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NR3C1P04150 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NR3C1P04150 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NR3C1P04150 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NR3C1P04150 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NR3C1P04150 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NR3C1P04150 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
NR3C1P04150 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NR3C1P04150 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NR3C1P04150 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NR3C1P04150 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NR3C1P04150 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NR3C1P04150 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NR3C1P04150 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NR3C1P04150 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NR3C1P04150 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NR3C1P04150 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NR3C1P04150 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NR3C1P04150 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NR3C1P04150 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NR3C1P04150 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NR3C1P04150 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NR3C1P04150 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NR3C1P04150 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NR3C1P04150 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NR3C1P04150 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NR3C1P04150 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NR3C1P04150 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NR3C1P04150 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NR3C1P04150 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
NR3C1P04150 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
NR3C1P04150 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
NR3C1P04150 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NR3C1P04150 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
NR3C1P04150 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NR3C1P04150 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NR3C1P04150 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NR3C1P04150 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NR3C1P04150 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NR3C1P04150 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NR3C1P04150 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NR3C1P04150 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NR3C1P04150 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NR3C1P04150 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NR3C1P04150 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NR3C1P04150 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NR3C1P04150 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NR3C1P04150 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NR3C1P04150 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NR3C1P04150 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NR3C1P04150 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms