Protein–RNA interactions for Protein: P02656

APOC3, Apolipoprotein C-III, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC3P02656 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
APOC3P02656 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
APOC3P02656 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
APOC3P02656 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
APOC3P02656 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
APOC3P02656 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
APOC3P02656 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
APOC3P02656 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
APOC3P02656 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
APOC3P02656 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
APOC3P02656 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
APOC3P02656 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
APOC3P02656 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
APOC3P02656 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
APOC3P02656 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
APOC3P02656 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
APOC3P02656 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
APOC3P02656 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
APOC3P02656 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
APOC3P02656 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
APOC3P02656 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
APOC3P02656 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
APOC3P02656 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
APOC3P02656 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
APOC3P02656 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
APOC3P02656 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
APOC3P02656 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
APOC3P02656 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
APOC3P02656 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
APOC3P02656 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
APOC3P02656 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
APOC3P02656 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
APOC3P02656 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
APOC3P02656 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
APOC3P02656 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
APOC3P02656 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
APOC3P02656 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
APOC3P02656 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
APOC3P02656 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
APOC3P02656 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
APOC3P02656 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
APOC3P02656 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
APOC3P02656 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
APOC3P02656 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
APOC3P02656 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
APOC3P02656 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
APOC3P02656 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
APOC3P02656 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
APOC3P02656 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
APOC3P02656 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
APOC3P02656 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
APOC3P02656 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
APOC3P02656 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
APOC3P02656 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
APOC3P02656 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
APOC3P02656 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
APOC3P02656 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
APOC3P02656 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
APOC3P02656 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
APOC3P02656 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
APOC3P02656 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
APOC3P02656 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
APOC3P02656 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
APOC3P02656 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
APOC3P02656 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
APOC3P02656 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
APOC3P02656 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
APOC3P02656 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
APOC3P02656 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
APOC3P02656 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
APOC3P02656 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
APOC3P02656 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
APOC3P02656 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
APOC3P02656 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
APOC3P02656 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
APOC3P02656 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
APOC3P02656 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
APOC3P02656 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
APOC3P02656 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
APOC3P02656 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
APOC3P02656 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
APOC3P02656 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
APOC3P02656 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
APOC3P02656 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
APOC3P02656 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
APOC3P02656 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
APOC3P02656 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
APOC3P02656 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
APOC3P02656 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
APOC3P02656 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
APOC3P02656 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
APOC3P02656 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
APOC3P02656 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
APOC3P02656 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
APOC3P02656 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
APOC3P02656 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
APOC3P02656 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
APOC3P02656 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
APOC3P02656 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
APOC3P02656 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms