Protein–RNA interactions for Protein: P01599

IGKV1-17, Immunoglobulin kappa variable 1-17, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV1-17P01599 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IGKV1-17P01599 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IGKV1-17P01599 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IGKV1-17P01599 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IGKV1-17P01599 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IGKV1-17P01599 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IGKV1-17P01599 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IGKV1-17P01599 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
IGKV1-17P01599 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IGKV1-17P01599 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IGKV1-17P01599 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
IGKV1-17P01599 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IGKV1-17P01599 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IGKV1-17P01599 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IGKV1-17P01599 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IGKV1-17P01599 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IGKV1-17P01599 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
IGKV1-17P01599 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IGKV1-17P01599 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IGKV1-17P01599 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IGKV1-17P01599 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IGKV1-17P01599 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IGKV1-17P01599 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IGKV1-17P01599 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IGKV1-17P01599 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IGKV1-17P01599 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IGKV1-17P01599 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IGKV1-17P01599 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IGKV1-17P01599 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IGKV1-17P01599 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IGKV1-17P01599 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IGKV1-17P01599 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IGKV1-17P01599 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IGKV1-17P01599 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IGKV1-17P01599 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IGKV1-17P01599 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IGKV1-17P01599 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
IGKV1-17P01599 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IGKV1-17P01599 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IGKV1-17P01599 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IGKV1-17P01599 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IGKV1-17P01599 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IGKV1-17P01599 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IGKV1-17P01599 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IGKV1-17P01599 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IGKV1-17P01599 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IGKV1-17P01599 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IGKV1-17P01599 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IGKV1-17P01599 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IGKV1-17P01599 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IGKV1-17P01599 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IGKV1-17P01599 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IGKV1-17P01599 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IGKV1-17P01599 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
IGKV1-17P01599 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
IGKV1-17P01599 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
IGKV1-17P01599 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
IGKV1-17P01599 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
IGKV1-17P01599 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
IGKV1-17P01599 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
IGKV1-17P01599 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
IGKV1-17P01599 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
IGKV1-17P01599 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
IGKV1-17P01599 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
IGKV1-17P01599 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
IGKV1-17P01599 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
IGKV1-17P01599 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
IGKV1-17P01599 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
IGKV1-17P01599 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
IGKV1-17P01599 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IGKV1-17P01599 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IGKV1-17P01599 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IGKV1-17P01599 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IGKV1-17P01599 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
IGKV1-17P01599 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
IGKV1-17P01599 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IGKV1-17P01599 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
IGKV1-17P01599 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IGKV1-17P01599 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IGKV1-17P01599 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IGKV1-17P01599 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
IGKV1-17P01599 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IGKV1-17P01599 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IGKV1-17P01599 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IGKV1-17P01599 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IGKV1-17P01599 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IGKV1-17P01599 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IGKV1-17P01599 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IGKV1-17P01599 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IGKV1-17P01599 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IGKV1-17P01599 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IGKV1-17P01599 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IGKV1-17P01599 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IGKV1-17P01599 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IGKV1-17P01599 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IGKV1-17P01599 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IGKV1-17P01599 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
IGKV1-17P01599 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IGKV1-17P01599 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IGKV1-17P01599 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms