Protein–RNA interactions for Protein: P01568

IFNA21, Interferon alpha-21, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNA21P01568 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
IFNA21P01568 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
IFNA21P01568 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
IFNA21P01568 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
IFNA21P01568 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
IFNA21P01568 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
IFNA21P01568 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
IFNA21P01568 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
IFNA21P01568 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
IFNA21P01568 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
IFNA21P01568 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
IFNA21P01568 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
IFNA21P01568 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
IFNA21P01568 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
IFNA21P01568 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
IFNA21P01568 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
IFNA21P01568 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
IFNA21P01568 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
IFNA21P01568 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
IFNA21P01568 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
IFNA21P01568 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
IFNA21P01568 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
IFNA21P01568 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
IFNA21P01568 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
IFNA21P01568 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
IFNA21P01568 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
IFNA21P01568 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
IFNA21P01568 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
IFNA21P01568 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
IFNA21P01568 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
IFNA21P01568 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
IFNA21P01568 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
IFNA21P01568 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
IFNA21P01568 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
IFNA21P01568 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
IFNA21P01568 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
IFNA21P01568 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
IFNA21P01568 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
IFNA21P01568 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
IFNA21P01568 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
IFNA21P01568 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
IFNA21P01568 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
IFNA21P01568 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
IFNA21P01568 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
IFNA21P01568 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
IFNA21P01568 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
IFNA21P01568 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
IFNA21P01568 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
IFNA21P01568 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
IFNA21P01568 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
IFNA21P01568 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
IFNA21P01568 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
IFNA21P01568 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
IFNA21P01568 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
IFNA21P01568 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
IFNA21P01568 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
IFNA21P01568 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
IFNA21P01568 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
IFNA21P01568 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
IFNA21P01568 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
IFNA21P01568 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
IFNA21P01568 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
IFNA21P01568 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
IFNA21P01568 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
IFNA21P01568 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
IFNA21P01568 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
IFNA21P01568 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
IFNA21P01568 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
IFNA21P01568 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
IFNA21P01568 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
IFNA21P01568 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
IFNA21P01568 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
IFNA21P01568 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
IFNA21P01568 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
IFNA21P01568 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
IFNA21P01568 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
IFNA21P01568 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
IFNA21P01568 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
IFNA21P01568 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
IFNA21P01568 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
IFNA21P01568 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
IFNA21P01568 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
IFNA21P01568 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
IFNA21P01568 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
IFNA21P01568 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
IFNA21P01568 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
IFNA21P01568 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
IFNA21P01568 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
IFNA21P01568 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
IFNA21P01568 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
IFNA21P01568 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
IFNA21P01568 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
IFNA21P01568 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
IFNA21P01568 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
IFNA21P01568 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
IFNA21P01568 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
IFNA21P01568 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
IFNA21P01568 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
IFNA21P01568 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
IFNA21P01568 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms