Protein–RNA interactions for Protein: P01133

EGF, Pro-epidermal growth factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGFP01133 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
EGFP01133 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EGFP01133 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EGFP01133 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EGFP01133 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EGFP01133 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EGFP01133 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EGFP01133 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
EGFP01133 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EGFP01133 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EGFP01133 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EGFP01133 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EGFP01133 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EGFP01133 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EGFP01133 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EGFP01133 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EGFP01133 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EGFP01133 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EGFP01133 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EGFP01133 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EGFP01133 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EGFP01133 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EGFP01133 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EGFP01133 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EGFP01133 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EGFP01133 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EGFP01133 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EGFP01133 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EGFP01133 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EGFP01133 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EGFP01133 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EGFP01133 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EGFP01133 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EGFP01133 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EGFP01133 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EGFP01133 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EGFP01133 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
EGFP01133 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EGFP01133 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EGFP01133 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
EGFP01133 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
EGFP01133 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
EGFP01133 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
EGFP01133 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
EGFP01133 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
EGFP01133 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
EGFP01133 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EGFP01133 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EGFP01133 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EGFP01133 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EGFP01133 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EGFP01133 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EGFP01133 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EGFP01133 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EGFP01133 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EGFP01133 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EGFP01133 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EGFP01133 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EGFP01133 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EGFP01133 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EGFP01133 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EGFP01133 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EGFP01133 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EGFP01133 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EGFP01133 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EGFP01133 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EGFP01133 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
EGFP01133 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
EGFP01133 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
EGFP01133 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EGFP01133 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EGFP01133 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EGFP01133 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EGFP01133 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
EGFP01133 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
EGFP01133 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
EGFP01133 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
EGFP01133 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
EGFP01133 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
EGFP01133 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
EGFP01133 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
EGFP01133 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
EGFP01133 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
EGFP01133 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
EGFP01133 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
EGFP01133 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
EGFP01133 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
EGFP01133 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EGFP01133 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EGFP01133 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
EGFP01133 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
EGFP01133 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
EGFP01133 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EGFP01133 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
EGFP01133 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
EGFP01133 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
EGFP01133 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
EGFP01133 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
EGFP01133 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
EGFP01133 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms