Protein–RNA interactions for Protein: O95859

TSPAN12, Tetraspanin-12, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN12O95859 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TSPAN12O95859 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TSPAN12O95859 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TSPAN12O95859 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TSPAN12O95859 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TSPAN12O95859 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TSPAN12O95859 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TSPAN12O95859 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TSPAN12O95859 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TSPAN12O95859 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TSPAN12O95859 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TSPAN12O95859 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TSPAN12O95859 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TSPAN12O95859 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TSPAN12O95859 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TSPAN12O95859 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TSPAN12O95859 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TSPAN12O95859 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TSPAN12O95859 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TSPAN12O95859 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TSPAN12O95859 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TSPAN12O95859 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TSPAN12O95859 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TSPAN12O95859 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TSPAN12O95859 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TSPAN12O95859 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TSPAN12O95859 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TSPAN12O95859 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TSPAN12O95859 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TSPAN12O95859 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TSPAN12O95859 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TSPAN12O95859 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TSPAN12O95859 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TSPAN12O95859 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TSPAN12O95859 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TSPAN12O95859 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TSPAN12O95859 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TSPAN12O95859 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TSPAN12O95859 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TSPAN12O95859 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TSPAN12O95859 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TSPAN12O95859 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TSPAN12O95859 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TSPAN12O95859 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TSPAN12O95859 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TSPAN12O95859 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TSPAN12O95859 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TSPAN12O95859 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TSPAN12O95859 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TSPAN12O95859 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TSPAN12O95859 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TSPAN12O95859 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TSPAN12O95859 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TSPAN12O95859 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TSPAN12O95859 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TSPAN12O95859 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TSPAN12O95859 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TSPAN12O95859 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TSPAN12O95859 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TSPAN12O95859 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TSPAN12O95859 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TSPAN12O95859 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TSPAN12O95859 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TSPAN12O95859 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TSPAN12O95859 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TSPAN12O95859 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TSPAN12O95859 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TSPAN12O95859 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TSPAN12O95859 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TSPAN12O95859 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TSPAN12O95859 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TSPAN12O95859 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TSPAN12O95859 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TSPAN12O95859 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TSPAN12O95859 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TSPAN12O95859 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TSPAN12O95859 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TSPAN12O95859 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
TSPAN12O95859 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TSPAN12O95859 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TSPAN12O95859 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TSPAN12O95859 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSPAN12O95859 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSPAN12O95859 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSPAN12O95859 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TSPAN12O95859 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSPAN12O95859 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSPAN12O95859 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSPAN12O95859 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSPAN12O95859 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSPAN12O95859 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSPAN12O95859 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TSPAN12O95859 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TSPAN12O95859 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TSPAN12O95859 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TSPAN12O95859 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TSPAN12O95859 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TSPAN12O95859 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TSPAN12O95859 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TSPAN12O95859 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms