Protein–RNA interactions for Protein: O95398

RAPGEF3, Rap guanine nucleotide exchange factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEF3O95398 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
RAPGEF3O95398 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
RAPGEF3O95398 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
RAPGEF3O95398 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
RAPGEF3O95398 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
RAPGEF3O95398 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
RAPGEF3O95398 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
RAPGEF3O95398 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
RAPGEF3O95398 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
RAPGEF3O95398 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
RAPGEF3O95398 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
RAPGEF3O95398 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.96■■■■□ 3.35
RAPGEF3O95398 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC35.96■■■■□ 3.35
RAPGEF3O95398 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC35.96■■■■□ 3.35
RAPGEF3O95398 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.35
RAPGEF3O95398 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC35.95■■■■□ 3.35
RAPGEF3O95398 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
RAPGEF3O95398 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
RAPGEF3O95398 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
RAPGEF3O95398 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
RAPGEF3O95398 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC35.93■■■■□ 3.34
RAPGEF3O95398 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
RAPGEF3O95398 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.93■■■■□ 3.34
RAPGEF3O95398 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
RAPGEF3O95398 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
RAPGEF3O95398 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
RAPGEF3O95398 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
RAPGEF3O95398 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
RAPGEF3O95398 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
RAPGEF3O95398 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC35.9■■■■□ 3.34
RAPGEF3O95398 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC35.9■■■■□ 3.34
RAPGEF3O95398 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
RAPGEF3O95398 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
RAPGEF3O95398 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
RAPGEF3O95398 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
RAPGEF3O95398 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC35.89■■■■□ 3.34
RAPGEF3O95398 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC35.89■■■■□ 3.34
RAPGEF3O95398 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
RAPGEF3O95398 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
RAPGEF3O95398 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC35.88■■■■□ 3.33
RAPGEF3O95398 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
RAPGEF3O95398 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC35.88■■■■□ 3.33
RAPGEF3O95398 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.87■■■■□ 3.33
RAPGEF3O95398 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
RAPGEF3O95398 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC35.87■■■■□ 3.33
RAPGEF3O95398 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC35.87■■■■□ 3.33
RAPGEF3O95398 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
RAPGEF3O95398 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC35.86■■■■□ 3.33
RAPGEF3O95398 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
RAPGEF3O95398 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC35.85■■■■□ 3.33
RAPGEF3O95398 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
RAPGEF3O95398 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
RAPGEF3O95398 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.84■■■■□ 3.33
RAPGEF3O95398 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
RAPGEF3O95398 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
RAPGEF3O95398 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
RAPGEF3O95398 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
RAPGEF3O95398 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
RAPGEF3O95398 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
RAPGEF3O95398 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC35.83■■■■□ 3.33
RAPGEF3O95398 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
RAPGEF3O95398 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC35.82■■■■□ 3.32
RAPGEF3O95398 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
RAPGEF3O95398 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC35.82■■■■□ 3.32
RAPGEF3O95398 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC35.81■■■■□ 3.32
RAPGEF3O95398 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC35.81■■■■□ 3.32
RAPGEF3O95398 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
RAPGEF3O95398 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC35.8■■■■□ 3.32
RAPGEF3O95398 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
RAPGEF3O95398 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
RAPGEF3O95398 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
RAPGEF3O95398 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
RAPGEF3O95398 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC35.79■■■■□ 3.32
RAPGEF3O95398 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
RAPGEF3O95398 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
RAPGEF3O95398 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC35.78■■■■□ 3.32
RAPGEF3O95398 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC35.77■■■■□ 3.32
RAPGEF3O95398 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.77■■■■□ 3.32
RAPGEF3O95398 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
RAPGEF3O95398 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC35.76■■■■□ 3.32
RAPGEF3O95398 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
RAPGEF3O95398 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
RAPGEF3O95398 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
RAPGEF3O95398 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
RAPGEF3O95398 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
RAPGEF3O95398 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC35.75■■■■□ 3.31
RAPGEF3O95398 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
RAPGEF3O95398 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC35.75■■■■□ 3.31
RAPGEF3O95398 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC35.74■■■■□ 3.31
RAPGEF3O95398 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC35.74■■■■□ 3.31
RAPGEF3O95398 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
RAPGEF3O95398 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
RAPGEF3O95398 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
RAPGEF3O95398 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC35.73■■■■□ 3.31
RAPGEF3O95398 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.73■■■■□ 3.31
RAPGEF3O95398 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
RAPGEF3O95398 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC35.73■■■■□ 3.31
RAPGEF3O95398 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
RAPGEF3O95398 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
RAPGEF3O95398 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms