Protein–RNA interactions for Protein: O95237

LRAT, Lecithin retinol acyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRATO95237 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRATO95237 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRATO95237 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRATO95237 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRATO95237 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRATO95237 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRATO95237 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRATO95237 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRATO95237 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRATO95237 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRATO95237 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRATO95237 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRATO95237 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
LRATO95237 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRATO95237 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRATO95237 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRATO95237 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRATO95237 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRATO95237 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRATO95237 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRATO95237 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRATO95237 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRATO95237 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRATO95237 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
LRATO95237 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRATO95237 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRATO95237 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRATO95237 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRATO95237 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRATO95237 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRATO95237 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRATO95237 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRATO95237 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRATO95237 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRATO95237 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRATO95237 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRATO95237 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRATO95237 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRATO95237 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
LRATO95237 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRATO95237 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRATO95237 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRATO95237 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRATO95237 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LRATO95237 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LRATO95237 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRATO95237 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRATO95237 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRATO95237 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRATO95237 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRATO95237 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRATO95237 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRATO95237 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRATO95237 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRATO95237 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRATO95237 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRATO95237 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRATO95237 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRATO95237 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRATO95237 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRATO95237 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRATO95237 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRATO95237 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRATO95237 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRATO95237 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRATO95237 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRATO95237 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRATO95237 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRATO95237 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRATO95237 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRATO95237 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRATO95237 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRATO95237 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRATO95237 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRATO95237 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRATO95237 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRATO95237 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRATO95237 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRATO95237 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRATO95237 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRATO95237 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
LRATO95237 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRATO95237 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRATO95237 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRATO95237 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
LRATO95237 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
LRATO95237 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRATO95237 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRATO95237 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRATO95237 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRATO95237 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRATO95237 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRATO95237 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRATO95237 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRATO95237 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRATO95237 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRATO95237 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRATO95237 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRATO95237 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRATO95237 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms