Protein–RNA interactions for Protein: O94907

DKK1, Dickkopf-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK1O94907 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DKK1O94907 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DKK1O94907 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DKK1O94907 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DKK1O94907 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DKK1O94907 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DKK1O94907 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DKK1O94907 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DKK1O94907 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
DKK1O94907 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DKK1O94907 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DKK1O94907 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DKK1O94907 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
DKK1O94907 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DKK1O94907 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DKK1O94907 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DKK1O94907 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DKK1O94907 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DKK1O94907 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DKK1O94907 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DKK1O94907 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DKK1O94907 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DKK1O94907 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DKK1O94907 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DKK1O94907 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
DKK1O94907 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DKK1O94907 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DKK1O94907 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DKK1O94907 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DKK1O94907 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DKK1O94907 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DKK1O94907 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DKK1O94907 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DKK1O94907 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DKK1O94907 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DKK1O94907 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DKK1O94907 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DKK1O94907 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DKK1O94907 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
DKK1O94907 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DKK1O94907 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DKK1O94907 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
DKK1O94907 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DKK1O94907 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DKK1O94907 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DKK1O94907 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DKK1O94907 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DKK1O94907 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DKK1O94907 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DKK1O94907 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
DKK1O94907 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DKK1O94907 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DKK1O94907 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DKK1O94907 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DKK1O94907 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DKK1O94907 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DKK1O94907 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DKK1O94907 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DKK1O94907 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DKK1O94907 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
DKK1O94907 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DKK1O94907 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DKK1O94907 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DKK1O94907 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DKK1O94907 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DKK1O94907 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DKK1O94907 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DKK1O94907 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DKK1O94907 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DKK1O94907 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
DKK1O94907 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DKK1O94907 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DKK1O94907 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DKK1O94907 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DKK1O94907 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DKK1O94907 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
DKK1O94907 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DKK1O94907 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
DKK1O94907 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
DKK1O94907 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DKK1O94907 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DKK1O94907 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DKK1O94907 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DKK1O94907 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DKK1O94907 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DKK1O94907 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DKK1O94907 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DKK1O94907 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DKK1O94907 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
DKK1O94907 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DKK1O94907 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DKK1O94907 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DKK1O94907 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DKK1O94907 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
DKK1O94907 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DKK1O94907 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DKK1O94907 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
DKK1O94907 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DKK1O94907 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DKK1O94907 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms