Protein–RNA interactions for Protein: O94906

PRPF6, Pre-mRNA-processing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF6O94906 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRPF6O94906 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRPF6O94906 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRPF6O94906 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRPF6O94906 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRPF6O94906 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRPF6O94906 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRPF6O94906 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRPF6O94906 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRPF6O94906 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRPF6O94906 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
PRPF6O94906 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
PRPF6O94906 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRPF6O94906 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRPF6O94906 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRPF6O94906 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRPF6O94906 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRPF6O94906 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRPF6O94906 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRPF6O94906 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRPF6O94906 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRPF6O94906 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRPF6O94906 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRPF6O94906 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
PRPF6O94906 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRPF6O94906 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRPF6O94906 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRPF6O94906 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PRPF6O94906 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PRPF6O94906 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PRPF6O94906 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PRPF6O94906 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PRPF6O94906 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRPF6O94906 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRPF6O94906 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRPF6O94906 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRPF6O94906 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRPF6O94906 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRPF6O94906 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRPF6O94906 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRPF6O94906 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
PRPF6O94906 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRPF6O94906 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRPF6O94906 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRPF6O94906 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRPF6O94906 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRPF6O94906 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRPF6O94906 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRPF6O94906 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRPF6O94906 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRPF6O94906 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRPF6O94906 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRPF6O94906 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRPF6O94906 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
PRPF6O94906 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRPF6O94906 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRPF6O94906 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRPF6O94906 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRPF6O94906 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRPF6O94906 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRPF6O94906 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRPF6O94906 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRPF6O94906 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRPF6O94906 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRPF6O94906 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRPF6O94906 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRPF6O94906 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRPF6O94906 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRPF6O94906 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRPF6O94906 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRPF6O94906 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRPF6O94906 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRPF6O94906 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRPF6O94906 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRPF6O94906 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PRPF6O94906 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PRPF6O94906 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
PRPF6O94906 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
PRPF6O94906 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRPF6O94906 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRPF6O94906 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRPF6O94906 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRPF6O94906 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRPF6O94906 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRPF6O94906 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRPF6O94906 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRPF6O94906 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRPF6O94906 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRPF6O94906 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRPF6O94906 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRPF6O94906 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRPF6O94906 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRPF6O94906 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRPF6O94906 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRPF6O94906 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRPF6O94906 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRPF6O94906 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRPF6O94906 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRPF6O94906 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRPF6O94906 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms