Protein–RNA interactions for Protein: O94886

TMEM63A, CSC1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 807 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM63AO94886 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMEM63AO94886 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMEM63AO94886 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMEM63AO94886 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMEM63AO94886 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMEM63AO94886 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMEM63AO94886 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMEM63AO94886 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
TMEM63AO94886 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMEM63AO94886 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
TMEM63AO94886 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMEM63AO94886 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMEM63AO94886 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMEM63AO94886 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMEM63AO94886 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMEM63AO94886 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMEM63AO94886 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TMEM63AO94886 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMEM63AO94886 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMEM63AO94886 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMEM63AO94886 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMEM63AO94886 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMEM63AO94886 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMEM63AO94886 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMEM63AO94886 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMEM63AO94886 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMEM63AO94886 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TMEM63AO94886 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TMEM63AO94886 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TMEM63AO94886 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TMEM63AO94886 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TMEM63AO94886 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TMEM63AO94886 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TMEM63AO94886 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMEM63AO94886 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMEM63AO94886 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMEM63AO94886 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMEM63AO94886 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMEM63AO94886 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMEM63AO94886 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMEM63AO94886 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMEM63AO94886 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMEM63AO94886 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMEM63AO94886 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMEM63AO94886 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
TMEM63AO94886 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMEM63AO94886 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMEM63AO94886 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMEM63AO94886 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMEM63AO94886 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMEM63AO94886 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMEM63AO94886 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
TMEM63AO94886 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMEM63AO94886 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMEM63AO94886 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMEM63AO94886 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMEM63AO94886 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMEM63AO94886 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMEM63AO94886 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
TMEM63AO94886 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TMEM63AO94886 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TMEM63AO94886 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TMEM63AO94886 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TMEM63AO94886 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TMEM63AO94886 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TMEM63AO94886 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMEM63AO94886 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMEM63AO94886 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMEM63AO94886 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMEM63AO94886 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMEM63AO94886 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMEM63AO94886 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMEM63AO94886 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMEM63AO94886 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TMEM63AO94886 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TMEM63AO94886 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TMEM63AO94886 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TMEM63AO94886 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
TMEM63AO94886 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TMEM63AO94886 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.4
TMEM63AO94886 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMEM63AO94886 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMEM63AO94886 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMEM63AO94886 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMEM63AO94886 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMEM63AO94886 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMEM63AO94886 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMEM63AO94886 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMEM63AO94886 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
TMEM63AO94886 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMEM63AO94886 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMEM63AO94886 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMEM63AO94886 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMEM63AO94886 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMEM63AO94886 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMEM63AO94886 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMEM63AO94886 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMEM63AO94886 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMEM63AO94886 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMEM63AO94886 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms